El equipo, ubicado inicialmente en el establecimiento de Acqua Acetosa, fue fundado en 1996. La intención inicial del equipo era centrarse en los jugadores de rugby más jóvenes, por lo que el equipo de seniors comenzó dos años después de la fundación del equipo, en 1998.
Unione Rugby Capitolina ganó dos campeonatos nacionales U.19: en la temporada 2002-2003, ganando a los rivales de Lazio-Primavera Rugby en la final celebrada en el Stadio Flaminio ; y en la temporada 2007-2008, empatando 14-14 con Benetton Treviso y ganando 2-1 en la tanda de penaltis de Fontanafredda (PD). El equipo también ganó un campeonato nacional Sub-17 en 2006-2007 en una intensa final jugada contra Petrarca Padua . En 2011 el Club consiguió el cuarto campeonato nacional, esta vez en la categoría Sub-16, superando al Rugby Rovigo .
1998 es el año en que el Club se muda a su propio establecimiento en Via Flaminia e inaugura el equipo seniores, compuesto principalmente por amigos y recién llegados. Capitolina, capitaneada por Stefano Montalto y dirigida por Luca Santaroni, parte de la serie C2 y logra obtener inmediatamente el ascenso a la serie C1, superando a todos los equipos de su liga. Al año siguiente se incorpora a Santaroni otro entrenador: Marco Iscaro, y juntos los dos entrenadores logran llevar al equipo a la serie B, después de apenas dos años de existencia del equipo.
En la temporada 2005/6, Capitolina ascendió a la liga de rugby más importante de Italia, la Super 10 , con un récord perfecto de 22 victorias y un total de 110 puntos. Ganaron los playoffs contra los rivales de la ciudad Rugby Roma con una victoria de 20–9 para llegar a la liga de rugby italiana más importante después de solo diez años de existencia.
Capitolina se había esforzado por ofrecer mejores resultados tanto en la liga nacional como en los diversos trofeos europeos que estaban disponibles. Aunque con un éxito limitado, las inversiones clave en infraestructura y jugadores comenzaron a tener un impacto.
Al final de la temporada 2008/2009, la Junta decidió no continuar con la fórmula existente de rugby "profesional" y retiró el First XV del campeonato italiano superior , otorgando así un lugar en el Super 10 a L'Aquila Rugby .