El pueblo de Yamagata fue creado el 1 de abril de 1889 dentro del distrito de Kita-Kunohe con el establecimiento del sistema municipal. El distrito de Kita-Kunohe y los distritos de Minami-Kunohe se fusionaron para formar el distrito de Kunohe el 1 de abril de 1897. La zona montañosa era conocida anteriormente por varias minas, especialmente arenas de hierro . El 6 de marzo de 2006, Yamagata se fusionó con la ciudad ampliada de Kuji .
El 1 de marzo de 2006, la aldea tenía una población estimada de 3.121 y una densidad de población de 7.89 personas por kilómetro de ². La superficie total era de 295,49 km².