Yamaguchia toyensis es uno de los muchos oligoquetos acuáticospertenecientes a la familia Lumbriculidae descubiertos en la isla de Hokkaidō , Japón , que parece ser uno de los tres "puntos críticos" dediversidad de lumbriculidos (los otros son las Montañas Rocosas y el lago Baikal ). El género lleva el nombre del gran taxónomo de oligoquetos , el profesor Hideji Yamaguchi.
Y. toyensis se recolectó originalmente en las partes profundas del lago Tōya , Hokkaido (de ahí su nombre), y se encuentra entre los lumbriculidos más cortos (7–11 mm). No está claro a qué parte de la filogenia de los lumbriculidos pertenece Y. toyensis . Parece carecer de caracteres novedosos con los que ubicarlo sin ambigüedades, pero tiene una combinación de características que no se encuentran en otros géneros de la familia: testículos y aurículas en el segmento X, un solo embudo masculino prosoporoso por aurícula y espermatecas en el segmento XI.