El itrio natural ( 39 Y) está compuesto por un solo isótopo itrio-89. Los radioisótopos más estables son 88 Y, que tiene una vida media de 106,6 días y 91 Y con una vida media de 58,51 días. Todos los demás isótopos tienen vidas medias de menos de un día, excepto 87 Y, que tiene una vida media de 79,8 horas, y 90 Y, con 64 horas. El modo de desintegración dominante por debajo del estable 89 Y es la captura de electrones y el modo dominante después es la emisión beta . Se han caracterizado treinta y cinco isótopos inestables.
90 Y existe en equilibrio con su isótopo parental estroncio -90, que es un producto de la fisión nuclear .