El Proyecto Genoma de Patógenos 100K fue lanzado en julio de 2012 por Bart Weimer (UC Davis) como una asociación académica, pública y privada. [1] Su objetivo es secuenciar los genomas de 100.000 microorganismos infecciosos para crear una base de datos de secuencias del genoma bacteriano para su uso en salud pública, detección de brotes y detección de patógenos bacterianos. Esto acelerará el diagnóstico de enfermedades transmitidas por alimentos y acortará los brotes de enfermedades infecciosas. [2]
Proyecto Genoma de Patógenos 100K | |
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Tipo de proyecto | una asociación académica, pública y privada |
Duración | Julio 2012 - |
Sitio web | 100kgenomes |
El Proyecto Genoma de Patógenos 100K es un proyecto de colaboración público-privada para secuenciar los genomas de 100.000 microorganismos infecciosos. El Proyecto Genoma 100K proporcionará una hoja de ruta para desarrollar pruebas para identificar patógenos y rastrear sus orígenes más rápidamente.
Socios anunciados en el lanzamiento del proyecto fueron UC Davis , Agilent Technologies , y los EE.UU. Food and Drug Administration , con los EE.UU. Centros para el Control y Prevención de Enfermedades y el Departamento de Agricultura de Estados Unidos ha señalado como colaboradores. A medida que avanzaba el proyecto, la asociación ha evolucionado para incluir o reemplazar a estos socios fundadores. El Proyecto Genoma de Patógenos 100K fue seleccionado por IBM / Mars Food Safety Consortium para las secuencias metagenómicas. [ cita requerida ]
El Proyecto Genoma de Patógenos 100K está llevando a cabo una secuenciación de próxima generación (NGS) de alto rendimiento para investigar los genomas de los microorganismos seleccionados , y la secuenciación del genoma completo se llevará a cabo en una pequeña cantidad de microorganismos para su uso como genoma de referencia . La mayoría de las cepas bacterianas se secuenciarán y ensamblarán como genomas preliminares; sin embargo, el proyecto también ha producido genomas cerrados para una variedad de patógenos entéricos en el bioproyecto 100K. [3] Los datos de este proyecto también están disponibles para su descarga en el sitio web del Proyecto Genoma de Patógenos 100K [1] .
Esta estrategia permite la colaboración mundial para identificar conjuntos de biomarcadores genéticos asociados con rasgos patógenos importantes. Este proyecto de patógenos microbianos de cinco años dará como resultado una base de datos pública y gratuita que contiene la información de la secuencia del genoma de cada patógeno. Las secuencias de genes completadas se almacenarán en la base de datos pública del Centro Nacional de Información Biotecnológica ( NCBI ) de los Institutos Nacionales de Salud ( NIH ) . [4] Con la base de datos, los científicos podrán desarrollar nuevos métodos para controlar las bacterias que causan enfermedades en la cadena alimentaria.
Referencias
- ^ Burton, Thomas (12 de julio de 2012). "La FDA tiene como objetivo rastrear los códigos genéticos de las bacterias transmitidas por los alimentos" . Wall Street Journal . Consultado el 16 de julio de 2018 .
- ^ Curtis Allen (12 de julio de 2012). "FDA, UC Davis, Agilent Technologies y CDC para crear una base de datos del genoma de patógenos alimentarios disponible públicamente" . Departamento de Salud y Servicios Humanos de EE. UU. Archivado desde el original el 2 de diciembre de 2016 . Consultado el 2 de diciembre de 2016 .
- ^ "Proyecto de patógenos alimentarios 100K" . Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU . Consultado el 1 de diciembre de 2016 .
- ^ "Proyecto de genoma 100K lanzado para secuenciar genomas de patógenos transmitidos por los alimentos y el agua" . Genomeweb LLC. 12 de julio de 2012. Archivado desde el original el 2 de diciembre de 2016 . Consultado el 2 de diciembre de 2016 .
enlaces externos
- Proyecto Genoma de Patógenos 100K
- ORO: Base de datos en línea de genomas
- Base de datos del proyecto del genoma
- SUPERFAMILIA
- La base de datos del genoma del erizo de mar
- NRCPB .