La elección de alcalde de la ciudad de Wellington de 1899 fue parte de las elecciones locales de Nueva Zelanda celebradas ese mismo año. La votación se llevó a cabo utilizando el método electoral estándar de primer paso .
En 1899, el alcalde titular John Rutherford Blair se retiró, lo que llevó al empresario local John Aitken a ser elegido alcalde de Wellington, superando los desafíos tanto de Kennedy Macdonald (un ex concejal) como de James Joseph Devine.