El equipo de fútbol americano Sioux Falls Cougars de 2006 representó a la Universidad de Sioux Falls en la temporada de fútbol americano NAIA de 2006 . Los Cougars ganaron el Campeonato Nacional de Fútbol NAIA de 2006 con una victoria de 23-19 sobre los St. Francis Cougars mejor clasificados . El equipo también ganó el campeonato de la Conferencia Atlética de Great Plains con un récord perfecto de 10-0. Este fue el segundo Campeonato NAIA de la escuela ( 1996 ). El equipo fue entrenado por Kalen DeBoer .