La Copa Amateur de Ucrania de 2006 fue la undécima temporada anual de la competencia eliminatoria de fútbol de Ucrania para equipos de fútbol amateur . El concurso comenzó el 22 de julio de 2006 y concluyó el 8 de octubre de 2006.
Este año ODEK Orzhiv partió desde los cuartos de final. Todos los demás equipos comenzaron desde los 1/8 de final.