El torneo tiene 5 etapas. Las primeras cuatro etapas se juegan como torneos de mini-liga todos contra todos , excepto la tercera etapa en la región IV, que se juega como una etapa eliminatoria. La etapa final incluye dos rondas eliminatorias y una etapa final de grupos de cuatro equipos para determinar los dos equipos promocionados.
La Copa Perú 2009 comenzó con la Etapa Distrital (en español : Etapa Distrital ) en febrero. La siguiente etapa fue la Etapa Provincial ( español : Etapa Provincial ) que comenzó, en junio. El torneo continuó con la Etapa Departamental ( español : Etapa Departamental ) en julio. Siguió el Regional Staged. El Estadio Nacional ( español : Etapa Nacional ) comenzó en noviembre. El ganador y subcampeón de la Etapa Nacional ascenderá a Primera División .
Cada región tenía dos equipos clasificados para la siguiente etapa. Los playoffs solo determinaron los respectivos ganadores regionales.
Región I
La Región I incluye equipos calificados de la región Amazonas, Lambayeque, Tumbes y Piura.
Grupo A
Pos
Equipo
Pld
W
D
L
GF
Georgia
GD
Ptos
1
Defensor San José
6
5
0
1
10
1
+9
15
2
Atlético Grau
5
3
0
2
9
5
+4
9
3
Dínamo
6
2
0
4
7
13
−6
6
4
Unión Santo Domingo
5
1
0
4
6
13
−7
3
Fuente: [ cita requerida ]
Grupo B
Pos
Equipo
Pld
W
D
L
GF
Georgia
GD
Ptos
1
San Francisco de Asís (LG)
6
4
1
1
11
7
+4
13
2
Barza
6
3
2
1
8
8
0
11
3
Universidad de Chiclayo
5
1
3
1
6
3
+3
6
4
Progreso Cultural
5
0
0
5
5
12
−7
0
Fuente: [ cita requerida ]
Eliminatoria
Equipo 1
Agg.
Equipo 2
1er tramo
2a etapa
Defensor San José
1-0
San Francisco de Asís (LG)
1-0
-
Región II
La Región II incluye equipos calificados de la región Ancash, Cajamarca, La Libertad y San Martín.
Grupo A
Pos
Equipo
Pld
W
D
L
GF
Georgia
GD
Ptos
1
Universitario (T)
8
6
0
2
21
5
+16
18
2
Descendencia Michiquillay
8
4
1
3
9
12
−3
13
3
Juventud Culebreña
7
3
1
3
11
12
−1
10
4
Deportivo Cali
6
2
0
4
10
11
−1
6
5
UTC
7
2
0
5
7
18
−11
6
Fuente: [ cita requerida ]
Grupo B
Pos
Equipo
Pld
W
D
L
GF
Georgia
GD
Ptos
1
Carlos A. Mannucci
6
3
1
2
10
2
+8
10
2
Ramón Castilla
6
3
1
2
10
9
+1
10
3
Deportivo Municipal (San Ignacio)
6
3
0
3
6
7
−1
9
4
Unión Tarapoto
6
1
2
3
8
15
−7
5
Fuente: [ cita requerida ]
Desempate
Equipo 1
Agg.
Equipo 2
1er tramo
2a etapa
Carlos A. Mannucci
4-2
Ramón Castilla
4-2
-
Región III
La Región III incluye equipos calificados de la región de Loreto y Ucayali.
Pos
Equipo
Pld
W
D
L
GF
Georgia
GD
Ptos
1
Tecnológico
6
4
1
1
15
11
+4
13
2
UNAP
6
2
2
2
9
9
0
8
3
Deportivo Bancos
6
2
2
2
10
11
−1
8
4
San Francisco de Asís (Contamana)
6
1
1
4
9
12
−3
4
Fuente: [ cita requerida ]
Desempate
Equipo 1
Agg.
Equipo 2
1er tramo
2a etapa
UNAP
4-2
Deportivo Bancos
4-2
-
Región IV
La Región IV incluye equipos calificados de la región de Lima y Callao. Esta región jugó como un sistema de copa eliminatoria y los finalistas se clasificaron.
Semifinales
Equipo 1
Agg.
Equipo 2
1er tramo
2a etapa
La Rural
2-0
Atlético Pilsen Callao
0-0
2-0
OSCURO
4-2
Atlético Centenario
1-0
3-2
Final
Equipo 1
Agg.
Equipo 2
1er tramo
2a etapa
La Rural
1-2
OSCURO
1-2
-
Región V
La V Región incluye equipos calificados de la región de Junín, Pasco y Huánuco.
Grupo A
Pos
Equipo
Pld
W
D
L
GF
Georgia
GD
Ptos
1
Alianza Universidad
4
3
1
0
9
4
+5
10
2
Deportivo Municipal (Yanahuanca)
4
1
1
2
5
7
−2
4
3
ADT
4
1
0
3
5
8
−3
3
Fuente: [ cita requerida ]
Grupo B
Pos
Equipo
Pld
W
D
L
GF
Georgia
GD
Ptos
1
León de Huánuco
4
3
1
0
7
1
+6
10
2
Deporte Ticlacayán
4
2
0
2
6
4
+2
6
3
Juventud Carhuacatac
4
0
1
3
0
8
−8
1
Fuente: [ cita requerida ]
Eliminatoria
Equipo 1
Agg.
Equipo 2
1er tramo
2a etapa
Alianza Universidad
1-1 (3-2p)
León de Huánuco
1-1
-
Región VI
La Región VI incluye equipos calificados de la región de Ayacucho, Huancavelica e Ica. Dos equipos clasificados de esta etapa.
Grupo A
Pos
Equipo
Pld
W
D
L
GF
Georgia
GD
Ptos
1
Froebel
4
2
1
1
5
3
+2
7
2
Juventud Media Luna
4
1
2
1
5
6
−1
5
3
Diablos Rojos (H)
4
0
3
1
2
3
−1
3
Fuente: [ cita requerida ]
Grupo B
Pos
Equipo
Pld
W
D
L
GF
Georgia
GD
Ptos
1
Deportivo Municipal (Huamanga)
4
3
1
0
18
3
+15
10
2
Olímpico Peruano
4
2
1
1
15
6
+9
7
3
Lircay social
4
0
0
4
3
27
−24
0
Fuente: [ cita requerida ]
Eliminatoria
Equipo 1
Agg.
Equipo 2
1er tramo
2a etapa
Froebel
2-0
Deportivo Municipal (Huamanga)
2-0
-
Región VII
La VII Región incluye equipos calificados de la región de Arequipa, Moquegua y Tacna.
Grupo A
Pos
Equipo
Pld
W
D
L
GF
Georgia
GD
Ptos
1
Unión Alfonso Ugarte
4
2
2
0
6
2
+4
8
2
San Lino
4
1
2
1
3
5
−2
5
3
Juventus Corazón
4
0
2
2
4
6
−2
2
Fuente: [ cita requerida ]
Grupo B
Pos
Equipo
Pld
W
D
L
GF
Georgia
GD
Ptos
1
Unión Minas (O)
4
4
0
0
17
3
+14
12
2
Enersur
4
2
0
2
7
6
+1
6
3
Mariscal Miller
4
0
0
4
3
18
−15
0
Fuente: [ cita requerida ]
Semifinales
Equipo 1
Agg.
Equipo 2
1er tramo
2a etapa
Unión Alfonso Ugarte
5-2
Enersur
2-1
3-1
Unión Minas (O)
8-2
San Lino
4-1
4-1
Región VIII
La VIII Región incluye equipos calificados de la región de Apurimac, Cusco, Madre de Dios y Puno.
Grupo A
Pos
Equipo
Pld
W
D
L
GF
Georgia
GD
Ptos
1
José María Arguedas
5
4
0
1
11
3
+8
12
2
Deportivo Garcilaso
6
3
1
2
14
12
+2
10
3
Franciscano San Román
5
2
2
1
13
11
+2
8
4
MINSA
6
0
1
5
7
19
−12
1
Fuente: [ cita requerida ]
Grupo B
Pos
Equipo
Pld
W
D
L
GF
Georgia
GD
Ptos
1
Diablos Rojos
6
3
1
2
17
9
+8
10
2
Deportivo Educación
6
3
1
2
9
6
+3
10
3
Humberto Luna
6
2
1
3
8
12
−4
7
4
Juventud La Joya
6
2
1
3
8
15
−7
7
Fuente: [ cita requerida ]
Desempate
Equipo 1
Agg.
Equipo 2
1er tramo
2a etapa
Diablos Rojos
4-1
Deportivo Educación
4-1
-
Eliminatoria
Equipo 1
Agg.
Equipo 2
1er tramo
2a etapa
José María Arguedas
3-6 (4-3) p
Diablos Rojos
1-6
2-0
Estadio Nacional
La Etapa Nacional comenzó el 8 de noviembre. Esta etapa contó con dos rondas eliminatorias y una etapa de grupos de cuatro equipos. El ganador ascenderá a Primera División y el subcampeón de la Etapa Nacional ascenderá a Segunda División Peruana .