Después de una carrera estelar de baloncesto en la escuela secundaria , Armstrong comenzó su carrera deportiva universitaria en 2001, con el equipo de baloncesto de la Universidad Estatal de Kansas . Jugó para Kansas State hasta la temporada 2002. Fue una selección de los 12 académicos All-Big 12 en 2002.
Armstrong se transfirió a la Universidad del Sur de Florida en 2003. 2003 fue una temporada de camisetas rojas de acuerdo con las regulaciones de la NCAA. Fue co-capitana del equipo de la temporada 2004. Afirmó haberse convertido al Islam poco después de su llegada al campus de Florida .
Armstrong generó una controversia cuando solicitó que se le permitiera jugar con ropa apropiada para el Islam. La escuela inicialmente no quería permitirle hacer esto, y Armstrong perdió su beca en la primera semana de septiembre de ese año.
El 11 de septiembre, la escuela anunció que iba a dar marcha atrás y dejaría que Armstrong usara un atuendo atlético modesto para sus juegos de baloncesto, y restablecería su beca. Armstrong y los funcionarios de la escuela se habían reunido el día anterior para discutir su reinstalación. Ahmed Bedler, portavoz del Consejo de Relaciones Estadounidenses-Islámicas , estuvo presente en la reunión y declaró que "no se debe pedir a una atleta que elija entre participar en actividades deportivas saludables y sus creencias religiosas profundamente arraigadas".
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