Alumno de Vincent d'Indy en la Schola Cantorum de Paris y de André Pirro en la Sorbona , la tesis Histoire et évolution des formules musicales du Ier au XVe siècle de L'ère chrétienne de Machabey, que defendió en 1928, otorgó un lugar importante a la música de Guillaume de Machaut , de quien fue uno de los especialistas al publicar la segunda edición completa de la Messe de Nostre Dame de (Guillaume de Machaut) en 1948, justo después de Jacques Chailley . En 1955 escribió una importante monografía en dos volúmenes: Guillaume de Machault, 130 -? - 1377: La vie et l'œuvre musical . También fue el autor de unTraité de La critique musicale , y otro titulado La Musicologie , así como varias biografías de compositores como su maestro Vincent d'Indy, Anton Bruckner , Maurice Ravel y Girolamo Frescobaldi .
Machabey también fue el editor de la Misa de Tournai y el tratado Terminorum musicæ diffinitorium de Johannes Tinctoris , y con Norbert Dufourcq y Félix Raugel , dirigió la Encyclopédie Larousse de la musique (1957-1958).