El ferrocarril de Atchison, Lincoln y Columbus fue inicialmente autorizado para construir desde el punto final del ferrocarril de Atchison y Nebraska , que estaba en la frontera de Nebraska y Kansas al norte de White Cloud, Kansas , hasta Columbus, Nebraska a través de Lincoln . El trabajo comenzó en 1871 y el ferrocarril de Atchison y Nebraska absorbió el ferrocarril de Atchison, Lincoln y Columbus el 3 de noviembre de 1871. El ferrocarril llegó a Lincoln en 1872. En enero de 1880, el ferrocarril fue comprado por Burlington and Missouri River Railroad, que a su vez se había comprado Chicago, Burlington y Quincy Railroad en 1872.