El sistema de simulación bioquímica y orgánica ( BOSS ) es un programa de modelado molecular de propósito general que realiza cálculos de mecánica molecular , simulaciones de mecánica estadística de Metropolis Monte Carlo y cálculos semiempíricos de Austin Model 1 (AM1), PM3 y PDDG / PM3 de mecánica cuántica . [1] Los cálculos de mecánica molecular cubren minimizaciones de energía, análisis de modo normal y búsqueda conformacional con los campos de fuerza de Potenciales optimizados para simulaciones de líquidos ( OPLS ). BOSS es desarrollado por el Prof. William L. Jorgensen en la Universidad de Yaley distribuido comercialmente por Cemcomco, LLC y Schrödinger , Inc.