BioCreAtIvE (Una evaluación crítica de los métodos de minería de texto en biología molecular ) consiste en un esfuerzo de toda la comunidad para evaluar los desarrollos de extracción de información y minería de texto en el dominio biológico. [1]
Fue precedido por la Copa Desafío de Descubrimiento de Conocimiento y Minería de Datos (KDD) para la detección de menciones de genes. [2]
En el primer desafío de BioCreAtIvE se plantearon tres tareas principales: la tarea de extracción de entidades, [3] la tarea de normalización de nombres de genes, [4] [5] y la tarea de anotación funcional de productos de genes. [6] Los conjuntos de datos producidos por este concurso sirven como un conjunto de prueba y entrenamiento Gold Standard para evaluar y entrenar herramientas Bio-NER y herramientas de extracción de anotaciones.
El segundo desafío BioCreAtIvE (2006-2007) también tenía 3 tareas: detección de menciones de genes, extracción de identificadores únicos para genes y extracción de información relacionada con interacciones físicas proteína-proteína. [7] Contó con la participación de 44 equipos de 13 países. [7]
La tercera edición de BioCreative incluyó por primera vez la Tarea Interactiva (IAT), diseñada para evaluar la usabilidad práctica de las herramientas de minería de texto en tareas de biocuración del mundo real . [8] [9]
BioCreative V tenía 5 pistas diferentes, [10] incluida una tarea interactiva (IAT) para la usabilidad de los sistemas de minería de texto [11] y una pista que usaba el formato BioC para seleccionar información para BioGRID . [12]