Esta categoría contiene artículos relacionados con la flora nativa de Japón . Los taxones del rango más bajo siempre se incluyen. Los taxones superiores se incluyen solo si son endémicos. Japón está dentro de la región más grande de Asia Oriental.
A los efectos de esta categoría, "Japón" se define de acuerdo con el Esquema geográfico mundial para el registro de distribuciones de plantas . Es decir, la región geográfica se define como la inclusión de las siguientes áreas, típicamente definidas por los límites políticos de sus constituyentes:
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