La superfamilia de canales catiónicos transmembrana se definió en InterPro y Pfam como la familia de canales iónicos tetraméricos . Estos incluyen los canales de sodio , potasio , [1] calcio , receptor de rianodina , HCN , CNG , CatSper y TRP . Este gran grupo de canales iónicos aparentemente incluye las familias 1.A.1 , 1.A.2 , 1.A.3 y 1.A.4 de la clasificación del transportador TCDB .
Canal de iones (eucariota) | ||||||||||
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Identificadores | ||||||||||
Símbolo | Ion_trans | |||||||||
Pfam | PF00520 | |||||||||
InterPro | IPR005821 | |||||||||
SCOP2 | 1bl8 / SCOPe / SUPFAM | |||||||||
TCDB | 1.A.1 | |||||||||
Superfamilia OPM | 8 | |||||||||
Proteína OPM | 2a79 | |||||||||
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Canal de iones (bacteriano) | ||||||||||
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Identificadores | ||||||||||
Símbolo | Ion_trans_2 | |||||||||
Pfam | PF07885 | |||||||||
InterPro | IPR013099 | |||||||||
SCOP2 | 1bl8 / SCOPe / SUPFAM | |||||||||
Proteína OPM | 1r3j | |||||||||
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Se describen como que tienen como mínimo dos hélices transmembrana que flanquean un bucle que determina la selectividad iónica del poro del canal. Muchos canales eucariotas tienen cuatro hélices transmembrana adicionales (TM) ( Pfam PF00520 ), relacionadas o vestigiales de la compuerta de voltaje . Las proteínas con solo dos hélices transmembrana ( Pfam PF07885 ) se encuentran más comúnmente en bacterias. Esto también incluye los canales de potasio rectificadores hacia adentro 2-TM ( Pfam PF01007 ) que se encuentran principalmente en eucariotas. Por lo general, existen dominios reguladores adicionales que sirven para regular la conducción de iones y la activación de canales. Los poros también pueden ser homotetrámeros o heterotetrámeros ; donde los heterotetrámeros pueden codificarse como genes distintos o como dominios de poros múltiples dentro de un único polipéptido. El HVCN1 y las proteínas tirosina-proteína fosfatasa putativas no contienen un dominio de poro de conducción iónica esperado, sino que tienen homología solo con el dominio del sensor de voltaje de los canales iónicos activados por voltaje .
Canales humanos con 6 hélices TM
Catión
Potencial transitorio del receptor
Canónico
- TRPC1 ; TRPC3 ; TRPC4 ; TRPC5 ; TRPC6 ; TRPC7
Melastatina
- TRPM1 ; TRPM2 ; TRPM3 ; TRPM4 ; TRPM5 ; TRPM6 ; TRPM7 ; TRPM8
Vainilloide
- TRPV1 ; TRPV2 ; TRPV3 ; TRPV4 ; TRPV5 ; TRPV6
Mucolipina
- MCOLN1 ; MCOLN2 ; MCOLN3 ;
Ankyrin
- TRPA1
TRPP
- PKD1L3 ;
Calcio
Dependiente del voltaje
- CACNA1A ; CACNA1B ; CACNA1C ; CACNA1D ; CACNA1E ; CACNA1F ; CACNA1G ; CACNA1H ; CACNA1I ; CACNA1S
Esperma
- CATSPER1 ; CATSPER2 ; CATSPER3 ; CATSPER4
Receptor de ryanodina
- RYR1 ; RYR2 ; RYR3
Potasio
Potasio dependiente de voltaje
Rectificador retardado
- K v α1.x - Shaker relacionado con : K v 1.1 ( KCNA1 ), K v 1.2 ( KCNA2 ), K v 1.3 ( KCNA3 ), K v 1.5 ( KCNA5 ), K v 1.6 ( KCNA6 ), K v 1.7 ( KCNA7 ), K v 1.8 ( KCNA10 )
- K v α2.x - Relacionado con Shab: K v 2.1 ( KCNB1 ), K v 2.2 ( KCNB2 )
- K v α3.x - Relacionado con Shaw: K v 3.1 ( KCNC1 ), K v 3.2 ( KCNC2 )
- K v α7.x: K v 7,1 ( KCNQ1 ) - KvLQT1 , K v 7,2 ( KCNQ2 ), K v 7,3 ( KCNQ3 ), K v 7,4 ( KCNQ4 ), K v 7,5 ( KCNQ5 )
- K v α10.x: K v 10.1 ( KCNH1 )
Potasio tipo A
- K v α1.x - Relacionado con Shaker: K v 1.4 ( KCNA4 )
- K v α3.x - Relacionado con Shaw: K v 3.3 ( KCNC3 ), K v 3.4 ( KCNC4 )
- K v α4.x - Relacionado con Shal: K v 4.1 ( KCND1 ), K v 4.2 ( KCND2 ), K v 4.3 ( KCND3 )
Rectificación hacia el exterior
- K v α10.x: K v 10,2 ( KCNH5 )
Rectificando interiormente
- K v α11.x - canales de potasio ether-a-go-go : K v 11.1 ( KCNH2 ) - hERG , K v 11.2 ( KCNH6 ), K v 11.3 ( KCNH7 )
Activando lentamente
- K v α12.x: K v 12.1 ( KCNH8 ), K v 12.2 ( KCNH3 ), K v 12.3 ( KCNH4 )
Modificador / silenciador
- K v α5.x: K v 5.1 ( KCNF1 )
- K contra α6.x: K contra 6.1 ( KCNG1 ), K contra 6.2 ( KCNG2 ), K contra 6.3 ( KCNG3 ), K contra 6.4 ( KCNG4 )
- K v α8.x: K v 8.1 ( KCNV1 ), K v 8.2 ( KCNV2 )
- K v α9.x: K v 9,1 ( KCNS1 ), K v 9,2 ( KCNS2 ), K v 9,3 ( KCNS3 )
Activado por calcio
BK
- K Ca 1.1 (BK, Slo1, Maxi-K, KCNMA1 )
SK
- K Ca 2.x: K Ca 2.1 ( KCNN1 ) - SK1, K Ca 2.2 ( KCNN2 ) - SK2, K Ca 2.3 ( KCNN3 ) - SK3
- K Ca 3.x: K Ca 3.1 ( KCNN4 ) - SK4
- K Ca 4.x: K Ca 4.1 ( KCNT1 ) - SLACK, K Ca 4.2 ( KCNT2 ) - SLICK
IK
- K Ca 3,1 (IKCa1, SK4 , KCNN4 )
Otras subfamilias
- K Ca 5,1 (Slo3, KCNU1 )
Potasio rectificador hacia adentro
Sodio
- NALCN
- SCN1A ; SCN2A ; SCN2A2 ; SCN3A ; SCN4A ; SCN5A ; SCN7A ; SCN8A ; SCN9A ; SCN10A ; SCN11A
- SLC9A10 ; SLC9A11
Activado por nucleótidos cíclicos
- CNGA1 ; CNGA2 ; CNGA3 ; CNGA4
- CNGB1 ; CNGB3
- HCN1 ; HCN2 ; HCN3 ; HCN4
- ITPR1 ; ITPR2 ; ITPR3
Protón
- HVCN1
Proteínas relacionadas
- TPTE , parte de la familia más grande de fosfatasa sensibles al voltaje
Canales humanos con 2 hélices TM en cada subunidad
Potasio
Canal de potasio de dominio de poros en tándem
- KCNK1 ; KCNK2 ; KCNK3 ; KCNK4 ; KCNK5 ; KCNK6 ; KCNK7 ; KCNK9 ; KCNK10 ; KCNK12 ; KCNK13 ; KCNK15 ; KCNK16 ; KCNK17 ; KCNK18
Canales no humanos
De dos poros
- TPCN1
- TPCN2
Potasio solo para poros
- KcsA
Potasio controlado por ligando
- GluR0 [2]
Potasio dependiente de voltaje
- KvAP [3]
KCa procariota
- Kch [4] [5]
- MthK [6] [7] [8] [9] [10]
- TrkA / TrkH [11] [12]
- KtrAB [13]
- GsuK [14]
- TM1088 [15]
Potasio regulado por voltaje y nucleótidos cíclicos
- MlotiK1 [16]
Sodio
- NaChBac [17]
- NaVAb [18]
- NaVAe1 [19]
- NaVAp [20]
- NaVMm [21]
No selectivo
- NaK [22]
Potasio rectificador interno procariota
- KirBac [23]
Diseñado
- NaK2CNG [24]
- NaK2K [25]
Referencias
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enlaces externos
- "Canales de iones controlados por voltaje" . Base de datos IUPHAR de receptores y canales de iones . Unión Internacional de Farmacología Básica y Clínica.