La base de datos de clasificación de transportadores (o TCDB ) es un sistema de clasificación aprobado por la Unión Internacional de Bioquímica y Biología Molecular (IUBMB) para proteínas de transporte de membrana , incluidos los canales iónicos . [1] [2] [3]
Clasificación
El nivel superior de clasificación y algunos ejemplos de proteínas con estructura 3D conocida:
1. Canales y poros
1.A canales de tipo α
- 1.A.1 Superfamilia de canales iónicos activados por voltaje
- 1.A.2 Familia de canales de rectificador interno K +
- 1.A.3 rianodina-inositol-1,4,5 trifosfato-receptor de Ca 2+ familia de canales
- 1.A.4 Potencial de receptor transitorio Familia de canales de Ca 2+
- 1.A.5 Familia de canales de cationes de policistina
- 1.A.6 epitelial de Na + familia de canales
- 1.A.7 Familia de canales de cationes del receptor P2X regulado por ATP
- 1.A.8 Superfamilia de proteínas intrínsecas principales
- 1.A.9 Receptor de neurotransmisores, bucle Cys, familia de canales iónicos activados por ligandos
- 1.A.10 Familia de receptores de neurotransmisores de canales iónicos activados por glutamato
- 1.A.11 Familia de transportadores de canales de amonio
- 1.A.12 Familia de canales de cloruro intracelular
- 1.A.13 Familia de canales de cloruro epitelial
- 1.A.14 Familia de transferencia de genes potenciada por testículos
- 1.A.15 Familia del canal 2 de cationes no selectivos
- 1.A.16 Familia de transportadores de formiato -nitrito
- 1.A.17 Familia de canales de cloruro dependientes de calcio
- 1.A.18 Familia Tic110 formadora de canales aniónicos con envoltura de cloroplasto
- 1.A.19 Familia de canales de matriz 2 del virus de la influenza tipo A
- 1.A.20 Familia de proteínas 3 que interactúan con BCL2 / Adenovirus E1B
- 1.A.21 Familia Bcl-2
- 1.A.22 Canal iónico mecanosensible de gran conductancia
- 1.A.23 Canal iónico mecanosensible de pequeña conductancia
- 1.A.24 Familia de conexinas formadoras de uniones huecas
- 1.A.25 Familia de las innexinas formadoras de uniones huecas
- 1.A.26 Familia del transportador E de Mg 2+
- 1.A.27 Familia Phospholemman
- 1.A.28 Familia de transportadores de urea
- 1.A.29 Familia de canales de urea / amida
- 1.A.30 H + - o Na + - superfamilia del motor flagelar MotAB bacteriano translocante / ExbBD de transporte de membrana externa
- 1.A.31 Familia de anexos
- 1.A.32 Familia de canales NB del virus de la influenza tipo B
- 1.A.33 Familia de proteínas de choque térmico 70 formadoras de canales catiónicos
- 1.A.34 Familia de complejos formadores de canales tipo unión gap de Bacillus
- 1.A.35 Familia de transportadores de iones metálicos CorA
- 1.A.36 Familia de canales de cloruro intracelular
- 1.A.37 CD20 Ca 2+ familia de canales
- 1.A.38 Familia de reguladores de pH de Golgi
- 1.A.39 Familia de canales CM2 del virus de la influenza tipo C
- 1.A.40 Familia de canales de Vpu del virus de la inmunodeficiencia humana tipo I
- 1.A.41 Familia del reovirus aviar p10 Vvroporina
- 1.A.42 Familia de la proteína R viral del VIH
- 1.A.43 Familia de exportadores de fluoruro o resistencia al alcanfor
- 1.A.44 Proteína pb2 de la punta de la cola formadora de poros de la familia del fago T5
- 1.A.45 Familia del inyectisoma del fago P22
- 1.A.46 Familia de bestrofinas formadoras de canales aniónicos
- 1.A.47 Canal selectivo de aniones sensible a nucleótidos, familia ICln
- 1.A.48 Familia Tweety del canal aniónico
- 1.A.49 Familia de las viroporinas del coronavirus humano ns12.9
- 1.A.50 Familia de fosfolamban ( regulador de Ca 2+ -canal y Ca 2+ -ATPasa)
- 1.A.51 La familia de canales de protones controlados por voltaje (VPC)
- 1.A.52 Familia de canales de Ca 2+ (CRAC) activados por liberación de Ca 2+ (CRAC-C)
- 1.A.53 Familia de canales selectivos de cationes de viroporina del virus de la hepatitis C P7 (VHC-P7)
- 1.A.54 Familia de canales de fuga Presenilin ER Ca 2+ (Presenilin)
- 1.A.55 El canal de Ca 2+ asociado a vesículas sinápticas , familia flor (flor)
- 1.A.56 La familia de transportadores de cobre (Ctr)
- 1.A.57 La viroporina del coronavirus del SARS humano (SARS-VP)
- 1.A.58 Familia de la proteína 2 de la matriz del virus de la influenza tipo B (BM2-C)
- 1.A.59 El péptido formador de poros del virus de la enfermedad de la bolsa, familia Pep46 (Pep46)
- 1.A.60 El péptido preformador de reovirus de mamíferos, familia Mu-1 (Mu-1)
- 1.A.61 Familia de la cadena F (péptido gamma) formadora de canales de nodavirus de insectos
- 1.A.62 Familia de canales catiónicos homotriméricos (TRIC)
- 1.A.63 La porina α-helicoidal de la membrana externa de Ignicoccus (familia I-OMP
- 1.A.64 Familia Plasmolipin (Plasmolipin)
- 1.A.65 Familia de la proteína de coronavirus viroporina E (viroporina E)
- 1.A.66 La familia Pardaxin (Pardaxin)
- 1.A.67 La familia de transportadores de membrana Mg 2+ (MMgT)
- 1.A.68 La familia de las viroporinas hidrófobas pequeñas virales (V-SH)
- 1.A.69 Familia de canales receptores de olores heteroméricos (HORC)
- 1.A.70 La molécula contra la familia de microbios A (MamA)
- 1.A.71 Familia de canales de proteínas solubles en ácido cerebral (canal BASP1)
- 1.A.72 La superfamilia Mer
- 1.A.73 Familia de proteínas de lisis de colicina (CLP)
- 1.A.74 La familia Mitsugumin 23 (MG23)
- 1.A.75 El nociceptor mecánico, familia piezo (piezo)
- 1.A.76 La familia de transportadores de magnesio1 (MagT1)
- 1.A.77 La familia Uniporter (MCU) Mg 2+ / Ca 2+
- 1.A.78 El canal selectivo de K + en la familia de endosomas y lisosomas (KEL)
- 1.A.79 La proteína de absorción de colesterol (ChUP) o la familia de absorción de ARN bicatenario
- 1.A.80 La familia NS4a Viroporin (NS4a)
- 1.A.81 La familia de canales de baja afinidad Ca 2+ (LACC)
- 1.A.82 Familia de canales de mecanotransducción de células ciliadas (HCMC)
- 1.A.83 Familia del virus SV40 Viroporin VP2 (SV40 VP2)
- 1.A.84 La familia de canales Ca 2+ del modulador de la homeostasis del calcio (CALHM-C)
- 1.A.85 Familia de poliovirus 2B viroporina (2B viroporina)
- 1.A.86 Familia del virus del papiloma humano tipo 16 (VPH16) Viroporina L2 (Viroporina L2)
- 1.A.87 La familia de los canales de calcio mecanosensibles (MCA)
- 1.A.88 La familia de los canales de potasio fúngicos (F-Kch)
- 1.A.89 Familia de coronavirus humano 229E viroporina (229E viroporina)
- 1.A.90 Familia del metaneumovirus humano (HMPV) Viroporina (HMPV-Viroporina)
- 1.A.91 La proteína asexual 3.2 ligada a la citoadherencia de la familia Plasmodium falciparum (Clag3)
- 1.A.92 Familia de Reovirus Viroporin VP10 (RVP10)
- 1.A.93 Familia de la proteína 3 no estructural viroporina (NS3) del virus de la lengua azul
- 1.A.94 Familia de glicoproteína 4 viroporina (NSP4) no estructural del rotavirus
- 1.A.95 Familia de ephemerovirus viroporin (EVVP)
- 1.A.96 Familia de viroporinas del virus del polioma humano (PVVP)
- 1.A.97 Familia de viroporinas E5 del virus del papiloma humano tipo 16 (VPH-E5)
- 1.A.98 Familia de la proteína P13 del virus linfotrópico T humano 1 (HTLV1-P13)
- 1.A.99 Familia de la proteína E de membrana pequeña del sobre del virus de la bronquitis infecciosa (IBV-E)
- 1.A.100 La supuesta familia Viroporina Rhabdoviridae, U5 (RV-U5)
- 1.A.101 Familia Pex11 (Pex11) formadora de poros peroxisomales
- 1.A.102 Familia de la viroporina PB1-F2 (PB1-F2) de la influenza A
- 1.A.103 Familia SH (SV5-SH) del virus de los simios 5 (virus de la parainfluenza 5)
- 1.A.104 El canal de Na + de biosíntesis flagelar propuesto , familia FlaH (FlaH)
- 1.A.105 La familia de dominio de quinasa de linaje mixto (MLKL)
- 1.A.106 La familia de canales de calcio activados por carga de calcio (CLAC)
- 1.A.107 La familia de las globinas formadoras de poros (Globin)
1.B. Porinas β-barril y otras proteínas de la membrana externa
- 1.B.1 Familia de porinas bacterianas generales
- 1.B.2 Familia de la porina clamidial (CP)
- 1.B.3 Familia de la porina de azúcar (SP)
- 1.B.4 Familia de porinas de Brucella-Rhizobium (BRP)
- 1.B.5 Familia de porinas Pseudomonas OprP (POP)
- 1.B.6 Familia de porinas OmpA-OmpF (OOP)
- 1.B.7 Familia de porinas Rhodobacter PorCa (RPP)
- 1.B.8 Familia de porinas mitocondriales y plástidas (MPP)
- 1.B.9 Familia de proteínas de la membrana externa FadL (FadL)
- 1.B.10 Familia de porinas de membrana externa formadoras de canales específicos de nucleósidos (Tsx)
- 1.B.11 Familia de porinas de ujier fimbrial de membrana externa (FUP)
- 1.B.12 Familia Autotransporter-1 (AT-1)
- 1.B.13 Familia de porinas de exportación de alginato (AEP)
- 1.B.14 Familia de receptores de membrana externa (OMR)
- 1.B.15 Familia de rafinosa porina (RafY)
- 1.B.16 Familia de amidas de cadena corta y urea porinas (SAP)
- 1.B.17 Familia del factor de membrana externa (OMF)
- 1.B.18 Familia de proteínas auxiliares de la membrana externa (OMA)
- 1.B.19 Familia de porinas OprB selectivas para glucosa (OprB)
- 1.B.20 Familia de secreción de dos parejas (TPS)
- 1.B.21 Familia de porinas OmpG (OmpG)
- 1.B.22 Familia de la secretina de la membrana bacteriana externa (secretina)
- 1.B.23 Familia de porinas cianobacterianas (CBP)
- 1.B.24 Porina micobacteriana
- 1.B.25 Familia de porinas de membrana externa (Opr)
- 1.B.26 Familia de la porina ciclodextrina (CDP)
- 1.B.31 Familia de Campylobacter jejuni oorin de la membrana externa principal (MomP)
- 1.B.32 Familia de porinas de membrana externa fusobacteriana (FomP)
- 1.B.33 Familia de porinas de inserción de proteínas de la membrana externa (complejo Bam) (OmpIP)
- 1.B.34 Porinas corinebacterianas
- 1.B.35 Familia de porinas específicas de oligogalacturonato (KdgM)
- 1.B.39 Porina bacteriana, familia OmpW (OmpW)
- 1.B.42 Familia de porinas de exportación de lipopolisacáridos de membrana externa (LPS-EP)
- 1.B.43 Familia Coxiella porin P1 (CPP1)
- 1.B.44 Familia de porinas de Porphyromonas gingivalis (PorT) con traslocación de proteínas probables
- 1.B.49 Familia de porinas Anaplasma P44 (A-P44)
- 1.B.48 Transportadores tipo Curli
- 1.B.54 Intimina / invasina (Int / Inv) o Autotransporter-3 familia
- 1.B.55 Familia de poliacetil-D-glucosamina porina (PgaA)
- 1.B.57 Familia de proteínas de la membrana principal externa de Legionella (LM-OMP)
- 1.B.60 Familia de porina Omp50 (Porina Omp50)
- 1.B.61 Familia de la porina delta-proteobacteriana (delta-porina)
- 1.B.62 Familia de porinas bacterianas putativas (PBP)
- 1.B.66 Familia putativa de porina 2 de barril beta (BBP2)
- 1.B.67 Familia putativa de porina-4 de barril beta (BBP4)
- 1.B.68 Superfamilia de porina-5 de barril beta putativa (BBP5)
- 1.B.70 Familia de canales de membrana externa (OMC)
- 1.B.71 Familia de porinas proteobacterianas / verrucomicrobianas (PVP)
- 1.B.72 Familia de porinas de membrana externa de protoclamidias (PomS / T)
- 1.B.73 Familia de biogénesis / ensamblaje de cápsulas (CBA)
- 1.B.78 DUF3374 Familia de porinas asociadas al transporte de electrones (ETPorin)
1.C Toxinas formadoras de poros (proteínas y péptidos)
- 1.C.3 Familia de las α- hemolisinas (αHL)
- 1.C.4 Familia de aerolisina
- 1.C.5 ε-toxina familia
- 1.C.11 Superfamilia de la toxina RTX
- 1.C.12 Complejo de ataque de membrana / superfamilia de perforina
- 1.C.13 Familia de las leucocidinas
- 1.C.14 Familia de citohemolisinas (CHL)
- 1.C.39 Familia de citolisina dependiente del colesterol activada por tiol
- 1.C.43 Familia de las liseninas
- 1.C.56 Familia de canales de cationes de Pseudomonas syringae HrpZ
- 1.C.57 Familia de citotoxinas clostridiales
- 1.C.58 La familia Microcin E492 / C24 (Microcin E492)
- 1.C.74 Familia de citotoxinas de serpiente (SCT)
- 1.C.97 Familia formadora de poros de pleurotolisina
1.D Canales no sintetizados ribosómicamente
- 1.D.1 La familia de canales de gramicidina A
- 1.D.2 La familia de las siringomicinas formadoras de canales
- 1.D.3 La familia Syringopeptina formadora de canales
- 1.D.4 La familia formadora de canales Tolaasin
- 1.D.5 Familia formadora de canales de antibióticos alameticina o peptaibol
- 1.D.6 Familia de canales de poli 3-hidroxibutirato de Ca 2+ complejados (cPHB-CC)
- 1.D.7 La familia Beticolin
- 1.D.8 La familia de las saponinas
- 1.D.9 La familia de canales de iones de poliglutamina (PG-IC)
- 1.D.10 La familia de canales formadores de ceramidas
- 1.D.11 La familia de las surfactinas
- 1.D.12 La familia Beauvericin (Beauvericin)
- 1.D.13 Antibióticos péptidos anfipáticos de administración de ADN (DAPA)
- 1.D.14 Familia de péptidos formadores de canales anfipáticos Leu / Ser sintéticos (l / S-SCP)
- 1.D.15 La familia de la daptomicina (daptomicina)
- 1.D.16 Familia de heptapéptidos formadores de poros anfipáticos sintéticos (SAPH)
- 1.D.17 Familia de péptidos de hoja β, formadores de poros y de diseño combinatorio
- 1.D.18 Familia de conjugados de guanosina-ácido biliar formadores de poros
- 1.D.19 Fármaco formador de canales de Ca 2+ , familia de las digitoxinas
- 1.D.20 Familia de agentes fúngicos / antibióticos macrólidos poliénicos formadores de poros (PMAA)
- 1.D.21 Familia de nanoporos lipídicos (LipNP)
- 1.D.22 El pigmento carotenoide translocador de protones, familia de la zeaxantina
- 1.D.23 Familia de antimicrobianos formadores de poros de fenileno etinileno (PEPA)
- 1.D.24 Familia de politeonamida B de esponja marina (pTB)
- 1.D.25 La familia de los foldameros de arilamina (AAF)
- 1.D.26 La familia del alcohol dihidrodehidrodiconiferílico 9'-O-β-D-glucósido (DDDC9G)
- 1.D.27 La familia de isósteres Thiourea
- 1.D.28 La familia Lipopeptaibol
- 1.D.29 La familia de oligocolatos macrocíclicos
- 1.D.30 El pilar artificial con hidrazida adjunta [5] Familia de canales areno (HAPA-C)
- 1.D.31 La familia de la anfotericina B
- 1.D.32 Familia de las novicidinas formadoras de poros
- 1.D.33 Familia de politeonamida B formadora de canales
- 1.D.34 Bolaamphiphiles oligoéster formador de canales
- 1.D.35 Familia de lipodepsipéptidos cíclicos formadores de poros
- 1.D.36 La familia de canales de iones oligoborneno
- 1.D.37 La familia Hibicuslide C
- 1.D.38 Familia de nanotubos de péptidos cíclicos (cPepNT)
- 1.D.39 Familia de canales de iones moleculares anfifílicos anfifílicos basados en azobenceno controlados por luz (AAM-IC)
- 1.D.40 Familia de poros toroidales lipídicos inducidos por proteínas
- 1.D.41 Familia de ionóforos (espirohexanólidos) de tipo sprotetonato
- 1.D.42 La familia del canal de areno (TPPA-C) del pilar tripéptido Phe-Arg [5]
- 1.D.43 Familia de canales de dinucleósidos de guanosina adaptados a triazol (TT-GDN-C)
- 1.D.44 El canal de iones sintéticos con la familia de ferroceno activo redox (ICRF)
- 1.D.45 Familia de poros de membrana de electroporación y sonoporación (SEMP)
- 1.D.46 La familia DNA Nanopore (DnaNP)
- 1.D.47 Familia de péptidos cíclicos sintéticos formadores de poros (PSCP)
- 1.D.48 Familia de la siringomicina E formadora de poros
- 1.D.49 Familia de canales radicales carotenoides transmembrana (CRC)
- 1.D.50 Familia de transportadores de aniones anfifílicos bis-catecol (AC-AT)
- 1.D.51 La familia de nanoporos de proteínas (ProNP)
- 1.D.52 Familia de nanoporos de macrociclo de oligoamida aromático (OmnNP)
- 1.D.53 Familia de nanotubos de péptidos gamma alfa (a, gPepNT)
- 1.D.54 Familia de canales de iones hexil-benzoureido-15-corona-5-éter selectivos de potasio (HBEC)
- 1.D.55 La familia de nanoporos a base de porfirina (PorNP)
- 1.D.56 Familia de nanoporos oligoméricos alfa-aminoisobutirato (Aib) (AibNP)
- 1.D.57 La familia Lipid Electro-Pore (LEP)
- 1.D.58 Familia de prodigioseno que transporta aniones (prodigioseno)
- 1.D.59 Familia de la perenosina transportadora de aniones (perenosina)
- 1.D.60 La familia de péptidos alfa, gamma-cíclicos (AGCP)
- 1.D.61 Familia de 2,6-bis (bencimidazol-2-il) piridina (ABBP) anionofórica
- 1.D.62 Familia formadora de canales derivados de bis-triazolil diGuanosina (TDG)
- 1.D.63 La familia de nanoporos basados en péptidos (PepNP)
- 1.D.64 Familia de nanotubos de carbono (CarNT)
- 1.D.65 Familia de anfidinol formador de poros (Amphidinol)
- 1.D.66 La familia de nanoporos de macromoléculas helicoidales (HmmNP)
- 1.D.67 Familia de canales iónicos de péptidos helicoidales modificados con éter Crown (CEHP)
- 1.D.68 Familia de polímeros de bloque pleurónico formadores de poros (PPBP)
- 1.D.69 La familia de nanoporos cónicos (ConNP)
- 1.D.70 La familia de nanoporos metálicos (Au / Ag / Pt / grafeno) (MetNP)
- 1.D.71 La familia de péptidos sintéticos TP359 (TP359)
- 1.D.72 Familia de receptores de trípode basados en triazina portadores de cloruro (CCTTR)
- 1.D.73 La familia de nanoporos de sílice mesoporosa (SilNP)
- 1.D.74 Familia de poros de duela de p-octifenilo rígido sintético sensible a estímulos (SSROP)
1.E Holins
1.F la fusión de vesículas poros
- 1.F.1 Familia de poros de fusión de vesículas sinaptosómicas (SVF-Pore)
- 1.F.2 La familia de exoquistes (exocistos) octaméricos
1.G Poros de fusión viral
- 1.G.1 Familia de la proteína de fusión de membranas formadoras de poros virales-1 (VMFP1)
- 1.G.2 Familia de la proteína de fusión de membranas formadoras de poros virales-2 (VMFP2)
- 1.G.3 Familia de la proteína de fusión de membranas formadoras de poros virales-3 (VMFP3)
- 1.G.4 Familia de la proteína de fusión 4 de la membrana formadora de poros virales (VMFP4)
- 1.G.5 Familia de la proteína de fusión de la membrana formadora de poros virales-5 (VMFP5)
- 1.G.6 Familia de la proteína de fusión hepadnaviral S (proteína VHB-S)
- 1.G.7 La familia de proteínas de fusión Reovirus FAST (R-FAST)
- 1.G.8 Familia de proteínas de fusión de arenavirus (AV-FP)
- 1.G.9 La familia Syncytin (Syncytin)
- 1.G.10 Familia del complejo de fusión de membranas del virus del herpes simple (HSV-MFC)
- 1.G.11 Familia del complejo de proteínas de entrada de células de poxvirus (PEP-C)
- 1.G.12 Familia de la proteína de fusión gp95 del virus de la leucosis aviar (ALV-gp95)
- 1.G.13 Familia de transmembrana pequeña asociada a la fusión de ortoreovirus (FAST)
- 1.G.14 Familia de proteínas formadoras de poros de fusión / hemaglutinina del virus de la influenza (Influenza-H / FPP)
- 1.G.15 Familia de glicoproteínas de envolvente principal GP64 (GP64) del virus de la poliedrosis nuclear de Autographa californica
- 1.G.16 Familia de péptidos de fusión (VIH-FP) del virus de la inmunodeficiencia humana tipo 1 (VIH-1)
- 1.G.17 Familia de glicoproteínas de la envoltura del virus de la leucemia bovina (BLV-Env)
- 1.G.18 El péptido de fusión SARS-CoV en la familia de precursores de glicoproteína de pico (SARS-FP)
- 1.G.19 Familia del complejo de fusión de membranas formadoras de poros de rotavirus (Rotavirus MFC)
- 1.G.20 La familia de glicoproteínas de fusión de envoltura de hantavirus Gc (Gc-EFG)
- 1.G.21 El virus de Epstein Barr (virus del herpes humano 4) Familia Gp42 (Gp42)
- 1.G.22 Familia de la glicoproteína gO (gO) del citomegalovirus (virus del herpes humano 5)
1.H Canales paracelulares
- 1.H.1 La familia Claudin Tight Junction (Claudin1)
- 1.H.2 Familia de invertebrados PMP22-Claudin (Claudin2)
1.I Canales unidos a membrana
- 1.I.1 Familia de complejos de poros nucleares , incluidas las carioferinas
- 1.i.2 Planta plasmodesmos familia
2. Transportadores impulsados por potencial electroquímico
2.A Porteadores ( uniportadores , simportadores , antiportadores )
- 2.A.1 Superfamilia de facilitadores principales (MFS), ver también Permeasa de lactosa , Permeasa de fosfato y Transportador de glucosa
- 2.A.2 El glucósido-pentosido-hexurónido (GPH): familia de transportadores de cationes
- 2.A.3 La familia de aminoácidos-poliaminas-organocation (APC)
- 2.A.4 Familia facilitadora de la difusión de cationes (CDF)
- 2.A.5 Zinc (Zn 2+ ) -Hierro (Fe 2+ ) Permeasa Familia
- 2.A.6 Superfamilia de división celular de resistencia- modulación , véase también proteína de membrana de exportación de proteína SecDF
- 2.A.7 La superfamilia de transportadores de fármacos / metabolitos (DMT)
- 2.A.8 La familia gluconato: H + Symporter (GntP)
- 2.A.9 La familia de insertosas de proteínas de membrana (YidC / Alb3 / Oxa1)
- 2.A.10 La familia del transportador 2-ceto-3-desoxigluconato (KdgT)
- 2.A.11 La familia Citrate-Mg 2+ : H + (CitM) Citrate-Ca 2+ : H + (CitH) Symporter (CitMHS)
- 2.A.12 ATP: Familia ADP Antiporter
- 2.A.13 Familia de absorción de dicarboxilato de C4 (Dcu)
- 2.A.14 Familia de lactato permeasa
- 2.A.15 Familia de transportadores de betaína / carnitina / colina (BCCT)
- 2.A.16 Familia de transportadores de dicarboxilato / resistencia a telurito
- 2.A.17 Familia de transportadores de oligopéptidos dependientes de protones
- 2.A.18 Familia de aminoácidos / auxinas permeasas (AAAP)
- 2.A.19 La familia Ca 2+ : Cation Antiporter (CaCA)
- 2.A.20 La familia de transportadores de fosfato inorgánico (PiT)
- 2.A.21 Solute: Familia de simportadores de sodio
- 2.A.22 El neurotransmisor: familia de simportadores de sodio
- 2.A.23 Familia Dicarboxilato / Aminoácido: Simportador de catión (Na + o H + ) (DAACS)
- 2.A.24 La familia de transportadores de 2-hidroxicarboxilato (2-HCT)
- 2.A.25 Alanina o glicina: Familia de transportadores de cationes (AGCS)
- 2.A.26 Familia de aminoácidos de cadena ramificada: simportadores de cationes (LIVCS)
- 2.A.27 La familia Glutamato: Simportador de Na + (ESS)
- 2.A.28 ácido biliar: Na + Symporter Familia
- 2.A.29 Familia de portadores mitocondriales
- 2.A.30 Familia de cotransportadores de cloruro de cationes (CCC)
- 2.A.31 Familia de intercambiadores de aniones
- 2.A.32 La familia de transportadores de silicio (Sit)
- 2.A.33 NhaA Na + : Familia H + Antiporter (NhaA)
- 2.A.34 La familia NhaB Na + : H + Antiporter (NhaB)
- 2.A.35 La familia NhaC Na + : H + Antiporter (NhaC)
- 2.A.36 Catión monovalente: Familia Proton Antiporter-1 (CPA1)
- 2.A.37 Catión monovalente: Familia Proton Antiporter-2 (CPA2)
- 2.A.38 K + Transporter (Trk) Familia
- 2.A.39 Nucleobase: Familia catiónica Symporter-1 (NCS1)
- 2.A.40 Nucleobase: Familia catiónica Symporter-2 (NCS2)
- 2.A.41 Familia de transportadores de nucleósidos concentrados (CNT)
- 2.A.42 La familia de la permeasa de aminoácidos hidroxi / aromáticos (HAAAP)
- 2.A.43 Familia de transportadores de cistina lisosomal (LCT)
- 2.A.45 Familia de eflujo de arsenito-antimonita
- 2.A.46 La familia Benzoato: H + Symporter (BenE)
- 2.A.47 anión divalente: Na + Symporter (DASS) Familia
- 2.A.48 Familia de portadores de folato reducido (RFC)
- 2.A.49 Familia de canal / portador de cloruro (ClC)
- 2.A.50 Familia de absorción de glicerol (GUP)
- 2.A.51 La familia de transportadores de iones cromados (CHR)
- 2.A.52 La familia de transportadores Ni 2+ -Co 2+ (NiCoT)
- 2.A.53 Familia de permeasas de sulfato (SulP)
- 2.A.54 Familia de portadores de tricarboxilato mitocondrial (MTC)
- 2.A.55 El ión metálico (Mn 2+ -iron) Transportador (Nramp) Familia
- 2.A.56 La familia de transportadores periplásmicos tripartitos independientes de ATP (TRAP-T)
- 2.A.57 La familia de transportadores de nucleósidos equilibrantes (ENT)
- 2.A.58 La familia del simportador fosfato: Na + (PNaS)
- 2.A.59 La familia de resistencia al arsénico-3 (ACR3)
- 2.A.60 Familia de transportadores de aniones orgánicos (OAT)
- 2.A.61 Familia de absorción de dicarboxilato C4 C (DcuC)
- 2.A.62 La familia NhaD Na + : H + Antiporter (NhaD)
- 2.A.63 El catión monovalente (K + o Na + ): familia Proton Antiporter-3 (CPA3)
- 2.A.64 Familia de focalización de arginina gemela (Tat)
- 2.A.65 Familia de transportadores de bilirrubina (BRT)
- 2.A.66 Superfamilia de Flippasa Multifármaco / Oligosacaridil-lípido / Polisacárido (MOP)
- 2.A.67 La familia de transportadores de oligopéptidos (OPT)
- 2.A.68 Familia de transportadores de p-aminobenzoil-glutamato (AbgT)
- 2.A.69 La familia de portadores de eflujo de auxina (AEC)
- 2.A.70 La familia Malonate: Na + Symporter (MSS)
- 2.A.71 Familia de transportadores de folato-biopterina (FBT)
- 2.A.72 La familia de K + Uptake Permease (KUP)
- 2.A.73 Familia de absorción de ácidos grasos de cadena corta (AtoE)
- 2.A.74 Familia de transportadores endosomales multifármacos (MET) de 4 TMS
- 2.A.75 La familia de exportadores de L-lisina (LysE)
- 2.A.76 La familia de la resistencia a la homoerina / treonina (RhtB)
- 2.A.77 La familia de resistencia al cadmio (CadD)
- 2.A.78 La familia de exportadores de aminoácidos de cadena ramificada (LIV-E)
- 2.A.79 Familia de exportadores de treonina / serina (ThrE)
- 2.A.80 La familia de transportadores de tricarboxilato (TTT)
- 2.A.81 El aspartato: familia del intercambiador de alanina (AAEx)
- 2.A.82 La familia de transportadores de solutos orgánicos (OST)
- 2.A.83 Familia de transportadores de bicarbonato (SBT) dependientes de Na +
- 2.A.84 La familia de exportadores de cloroplasto maltosa (MEX)
- 2.A.85 La familia de exportadores de ácidos aromáticos (ArAE)
- 2.A.86 La familia Autoinducer-2 Exporter (AI-2E) (anteriormente, la familia PerM, TC # 9.B.22)
- 2.A.87 Familia de transportadores de riboflavina procariótica (P-RFT)
- 2.A.88 Familia de transportadores de absorción de vitaminas (VUT o ECF)
- 2.A.89 La familia de transportadores de hierro Vacuolar (VIT)
- 2.A.90 Familia de receptores / transportadores de vitamina A (STRA6)
- 2.A.91 Complejo de importación de ARNt mitocondrial (M-RIC) (anteriormente 9.C.8)
- 2.A.92 Familia tipo transportador de colina (CTL)
- 2.A.94 La familia de la fosfato permeasa (Pho1)
- 2.A.95 La familia de transportadores de aminoácidos neutros (NAAT) 6TMS
- 2.A.96 Familia de transportadores de absorción de acetato (AceTr)
- 2.A.97 Familia de intercambiadores de membrana interna mitocondrial K + / H + y Ca 2+ / H + (LetM1)
- 2.A.98 La familia de supuestos exportadores de sulfato (PSE)
- 2.A.99 La familia de transportadores de captación 6TMS Ni 2+ (HupE-UreJ)
- 2.A.100 La familia Ferroportin (Fpn)
- 2.A.101 La familia de absorción de malonatos (MatC) (anteriormente UIT1)
- 2.A.102 La familia de permeasa de absorción de sulfonato de 4-tolueno (TSUP)
- 2.A.103 Familia de exportadores de precursores de mureína bacteriana (MPE)
- 2.A.104 La familia de exportadores de L-alanina (AlaE)
- 2.A.105 Familia de portadores de piruvato mitocondrial (MPC)
- 2.A.106 La familia Ca 2+ : H + Antiporter-2 (CaCA2)
- 2.A.107 La familia de exportadores MntP Mn 2+ (MntP)
- 2.A.108 La familia de transportadores de hierro / plomo (ILT)
- 2.A.109 La familia de resistencia a iones de telurio (TerC)
- 2.A.110 El transportador de hemo, familia de proteínas génicas sensibles al hemo (HRG)
- 2.A.111 La familia Na + / H + Antiporter-E (NhaE)
- 2.A.112 Familia de antígenos del grupo sanguíneo KX (KXA)
- 2.A.113 La familia de transportadores de níquel / cobalto (NicO)
- 2.A.114 La supuesta familia CstA (CstA) del transportador de péptidos por inanición de carbono
- 2.A.115 La familia de exportadores de novobiocina (NbcE)
- 2.A.116 La familia de proteínas de tratamiento de peptidoglicolípidos (GAP)
- 2.A.117 La familia de exportadores de clorhexadina (CHX)
- 2.A.118 La familia de antiportadores de aminoácidos básicos (ArcD)
- 2.A.119 La familia de exportadores de organoarsenical (ArsP)
- 2.A.120 La familia putativa de permeasas de aminoácidos (PAAP)
- 2.A.121 La familia de transportadores de sulfato (CysZ)
- 2.A.122 La familia de proteínas auxiliares de tipo holina LrgB / CidB (LrgB / CidB)
- 2.A.123 El dulce; PQ-loop; Saliva; Familia MtN3 (dulce)
- 2.A.124 La familia de exportadores de lisina (LysO)
- 2.A.125 La familia de transportadores eucariotas de riboflavina (E-RFT)
- 2.A.126 La familia de exportadores de ácidos grasos (FAX)
- 2.A.127 Familia de transportadores de cardiolipina enterobacteriana (CLT)
2.B Porters sintetizados no ribosómicamente
- 2.B.1 Familia de portadores de valinomicina
- 2.B.2 La monensina Familia
- 2.B.3 La familia nigericina
- 2.B.4 La familia de antibióticos macrotetrolida (MA)
- 2.B.5 La familia de poliéteres macrocíclicos (MP)
- 2.B.6 El ionomicina Familia
- 2.B.7 La familia de translocación de péptidos fosfolípidos α-helicoidales transmembrana (TMP-PLT)
- 2.B.8 La familia de la bafilomicina A1 (bafilomicina)
- 2.B.9 La familia funcional del péptido penetrante celular (CPP)
- 2.B.10 El CPP sintético, familia Transportan
- 2.B.11 Familia de ionóforos tipo portador de calcimicina o A23187
- 2.B.12 La familia de la salinomicina
- 2.B.13 Familia de antiportadores de aniones macrocíclicos tetrapirrólicos (TPMC-AA)
- 2.B.14 La familia de ionóforos (Lasalocid) Lasalocid A o X-537A
- 2.B.15 La familia de portadores de cloruro basados en trípode de tris-tiourea (TTT-CC)
- 2.B.16 Familia de portadores de aniones compuestos que contienen enlaces halógenos (HCAC)
- 2.B.17 El derivado de isoftalamina H + : Cl - Familia de cotransportadores (IDC)
- 2.B.18 El derivado de piridina-2,6-dicarboxamina (PDCA) H +: Cl - Familia de cotransportadores
- 2.B.19 Familia de derivados de pirrol (C4P) de Calix (4)
- 2.B.20 Familia de intercambiadores de cloruro / bicarbonato de prodigiosina (prodigiosina)
- 2.B.21 Familia de transportadores de aniones derivados de orto-fenilendiamina-bis-urea (oPDA-U)
- 2.B.22 Familia de transportadores de aniones funcionalizados con imidazolio (IAT)
- 2.B.23 La transmembrana homotetramérica Zn 2+ / Co 2+ : Antipportador sintético de protones, familia Rocker (Rocker)
- 2.B.24 Familia de portadores de aniones de 2,6-bis (benzimidazol-2-il) piridina (BBP-AC)
- 2.B.25 La familia de flip-flop lipídicos mediada por péptidos (PLFF)
- 2.B.26 Familia del conjugado bis (choloilo) funcionalizado con bis (imidazolilo) (BIBCC)
- 2.B.27 La familia de transportadores de aniones tris-urea
- El 2.B.29 Anionophoric Marina alcaloide Tambjamine Familia
2.C Energizadores impulsados por gradientes de iones
- 2.C.1 Familia de proteínas auxiliares TonB-ExbB-ExbD / TolA-TolQ-TolR (TonB) para la activación del transporte activo mediado por el receptor de membrana externa (OMR)
3. Transportadores activos primarios
3.A. Transportadores impulsados por hidrólisis con enlaces de PP
- 3.A.1 Transportadores ABC que incluyen BtuCD, transportador de captación de molibdato, regulador de conductancia transmembrana de fibrosis quística y otros
- 3.A.2 El H + - o Na + -translocating de tipo F ATPasa , del tipo en V de la ATPasa y de tipo A ATPasa superfamilia
- 3.A.3 La superfamilia de ATPasa tipo P
- 3.A.4 La familia de eflujo de arsenito-antimonita
- 3.A.5 Vía secretora general (Sec) translocón (preproteína translocasa SecY)
- 3.A.6 La familia de la vía secretora de tipo III (relacionada con la virulencia) (IIISP)
- 3.A.7 La familia de la vía secretora (IVSP) de tipo IV (transferencia de proteína de ADN conyugal o VirB)
- 3.A.8 La familia de proteínas translocasas mitocondriales (MPT)
- 3.A.9 La familia de la proteína de envoltura de cloroplasto Translocase (CEPT o Tic-Toc)
- 3.A.10 H + , Na + -translocating Pyrophosphatase familia
- 3.A.11 La familia de transportadores de transformación de ADN relacionados con la competencia bacteriana (ADN-T)
- 3.A.12 La familia de translocadores de ADN septal (S-DNA-T)
- 3.A.13 La familia de exportadores de fagos filamentosos (FPhE)
- 3.A.14 La familia de exportadores de proteínas / fimbrilina (FPE)
- 3.A.15 Familia de ramas terminales principales secretoras de proteínas de la membrana externa (MTB)
- 3.A.16 La familia del retrotranslocón reticular endoplásmico (ER-RT)
- 3.A.17 La familia del inyectisoma del fago T7 (inyectisoma T7)
- 3.A.18 La familia de exportadores de ARNm nuclear (ARNm-E)
- 3.A.19 La familia TMS Recognition / Insertion Complex (TRC)
- 3.A.20 La familia de importadores de proteínas peroxisómicas (PPI)
- 3.A.21 Familia del complejo de inserción / biogénesis de proteínas de membrana anclada en la cola (TAMP-B) C-terminal
- 3.A.22 La familia del complejo de exportación de ARNm nuclear TREX / TAP acoplado a transcripción (TREX)
- 3.A.23 Familia de la vía secretora de simbiosis / virulencia (VISP) de tipo VI
- 3.A.24 Familia de sistemas de secreción de proteínas de tipo VII o ESX (T7SS)
- 3.A.25 La familia de maquinaria similar a ERAD (SELMA) específica de Symbiont
- 3.A.26 Familia Plasmodium Translocon de proteínas exportadas (PTEX)
3.B Transportadores impulsados por descarboxilación
- 3.B.1 Familia de la descarboxilasa del ácido carboxílico que transporta Na + (NaT-DC)
3.C Transportadores impulsados por transferencia de metilo
- 3.C.1 La metiltetrahidrometanopterina transportadora de Na + : familia de la coenzima M metiltransferasa (NaT-MMM)
3.D. Transportadores impulsados por oxidorreducción
Incluyen una serie de proteínas transmembrana similares al citocromo b , incluida la coenzima Q - citocromo c reductasa (citocromo bc1); complejo de citocromo b6f ; formiato deshidrogenasa, nitrato reductasa respiratoria ; succinato - coenzima Q reductasa (fumarato reductasa); y succinato deshidrogenasa . Ver cadena de transporte de electrones .
- 3.D.1 La familia de la NADH deshidrogenasa ("complejo I") translocadora de H + o Na +
- 3.D.2 La familia de las transhidrogenasas translocadoras de protones (PTH)
- 3.D.3 El quinol translocador de protones: citocromo c reductasa ) Superfamilia
- 3.D.4 Superfamilia de citocromo oxidasa translocadora de protones (COX)
- 3.D.5 La familia de NADH: quinona deshidrogenasa (Na-NDH o NQR) translocadora de Na +
- 3.D.6 La supuesta NADH translocante de iones (H + o Na + ): familia de ferredoxina oxidorreductasa (NFO o RNF)
- 3.D.7 La familia H 2 : heterodisulfuro oxidorreductasa (HHO)
- 3.D.8 Familia de formilmetanofurano deshidrogenasa de bombeo de Na + o H + (FMF-DH)
- 3.D.9 La familia de la deshidrogenasa F420H2 (F420H2DH) de translocación de H +
- 3.D.10 Familia de succinato deshidrogenasa procariota (SDH)
3.E. Transportadores impulsados por absorción de luz
- Proteínas similares a la bacteriorrodopsina , incluida la rodopsina (ver también opsina )
- Centros de reacción fotosintética bacteriana y fotosistemas I y II
- Complejos de captación de luz de bacterias y cloroplastos
4. Translocadores de grupo
4.A Translocadores grupales impulsados por fosfotransferencias
- 4.A.1 La familia glucosa-glucósido (Glc) de PTS
- 4.A.2 La familia PTS fructosa-manitol (Fru)
- 4.A.3 La familia PTS Lactosa-N, N'-Diacetilchitobiosa-β-glucósido (Lac)
- 4.A.4 La familia del glucitol (intestino) de PTS
- 4.A.5 La familia PTS Galactitol (Gat)
- 4.A.6 La familia PTS manosa-fructosa-sorbosa (hombre)
- 4.A.7 La familia PTS L-ascorbato (L-Asc)
4.B Transportadores de captación de ribonucleósidos de nicotinamida
- 4.B.1 Familia de permeasa de captación de ribonucleósido de nicotinamida (NR) (PnuC)
Transportadores acoplados a ligasa 4.C Acil CoA
- 4.C.1 La familia de transportadores de ácidos grasos (FAT) propuesta
- 4.C.2 Familia de la carnitina O-acil transferasa (CrAT)
- 4.C.3 Familia de acil-CoA tioesterasa (AcoT)
4.D Polisacárido sintasa / Exportadores
- 4.D.1 La familia putativa de polimerización de glicosilo vectorial (VGP)
- 4.D.2 La familia de glucosil transferasa 2 (GT2)
- 4.D.3 Familia de glicanos glucosil transferasa (OpgH)
4.E. Translocadores de grupo catalizados por polifosfato vacuolar polimerasa
- 4.E.1 La familia de polifosfato polimerasa (V-PPP) vacuolar (acidocalcisoma)
5. Transportadores de electrones
5.A Portadores de transferencia transmembrana de 2 electrones
- 5.A.1 Familia de enlaces disulfuro oxidorreductasa D (DsbD)
- 5.A.2 Familia de enlaces disulfuro oxidorreductasa B (DsbB)
- 5.A.3 Familia de oxidorreductasa (PMO) que contiene molibdopterina procariota
5.B Portadores de transferencia transmembrana de 1 electrón
- 5.B.1 La familia de los fagocitos (gp91phox) NADPH oxidasa
- 5.B.2 La familia eucariota del citocromo b561 (Cytb561)
- 5.B.3 La familia de transferencia de electrones de nanocables de Geobacter (G-NET)
- 5.B.4 La familia de supercomplejos del fotosistema I de plantas (PSI)
- 5.B.5 La familia de oxido-reductasa de metales extracelulares (EMOR)
- 5.B.6 Familia de la reductasa férrica de la proteína 3 del antígeno epitelial transmembrana (STEAP)
- 5.B.7 La familia YedZ (YedZ)
- 5.B.8 La familia del complejo de citocromo / porina de transferencia de electrones de membrana transexual (ET-PCC)
- 5.B.9 La familia de porina-citocromo c (Cyc2)
8. Factores accesorios que intervienen en el transporte
8.A Proteínas de transporte auxiliares
8.B Toxinas proteicas / peptídicas sintetizadas ribosómicamente que se dirigen a canales y portadores
8.C Toxinas no sintetizadas ribosómicamente que se dirigen a canales y portadores
9. Sistemas de transporte incompletamente caracterizados
9.A Transportadores reconocidos de mecanismo bioquímico desconocido
9.B Proteínas de transporte putativas
9.C Transportadores funcionalmente caracterizados que carecen de secuencias identificadas
Referencias
- ^ Saier, Milton H .; Reddy, Vamsee S .; Tamang, Dorjee G .; Västermark, Åke (enero de 2014). "La base de datos de clasificación de transportadores" . Investigación de ácidos nucleicos . 42 (D1): D251 – D258. doi : 10.1093 / nar / gkt1097 . PMC 3964967 . PMID 24225317 .
- ^ Saier, MH; Yen, MR; No está bien.; Tamang, DG; Elkan, C. (1 de enero de 2009). "La base de datos de clasificación de transportadores: avances recientes" . Investigación de ácidos nucleicos . 37 (Base de datos): D274 – D278. doi : 10.1093 / nar / gkn862 . PMC 2686586 . PMID 19022853 .
- ^ Saier, MH; Tran, CV; Barabote, RD (1 de enero de 2006). "TCDB: la base de datos de clasificación de transportadores para información y análisis de proteínas de transporte de membrana" . Investigación de ácidos nucleicos . 34 (90001): D181 – D186. doi : 10.1093 / nar / gkj001 . PMC 1334385 . PMID 16381841 .
enlaces externos
- Base de datos de clasificación de transportadores
- Lista en qmul.ac.uk
- Saier MH, Tran CV, Barabote RD (enero de 2006). "TCDB: la base de datos de clasificación de transportadores para información y análisis de proteínas de transporte de membrana" . Ácidos nucleicos Res . 34 (Problema de la base de datos): D181–6. doi : 10.1093 / nar / gkj001 . PMC 1334385 . PMID 16381841 .
- Busch W., Saier MH (2002). "El sistema de clasificación de transportadores (TC), 2002". Crit. Rev. Biochem. Mol. Biol . 37 (5): 287–337. doi : 10.1080 / 10409230290771528 . PMID 12449427 . S2CID 10558982 .
- Clasificación de transportadores humanos en farmacología