El cuerpo de Ciona tiene forma de bolsa y está cubierto por una túnica , que es una secreción de las células epidérmicas . El cuerpo está unido a una base permanente ubicada en la parte posterior, y el opuesto lleva dos aberturas, los sifones bucal ( oral ) y auricular ( cloacal ) . El agua ingresa a la ascidia a través del sifón bucal y sale del atrio a través del sifón auricular.
C. intestinalis es un hermafrodita que libera espermatozoides y óvulos casi simultáneamente en el agua de mar circundante. C. intestinalis es autoestéril y, por lo tanto, se ha utilizado para estudios sobre el mecanismo de autoincompatibilidad. [4] C. savigny es altamente autofértil, pero los espermatozoides no propios superan a los espermatozoides propios en los ensayos de competencia de fertilización. [5] Los mecanismos que promueven la no autofecundación pueden haber evolucionado para evitar la depresión endogámica , [5] y para facilitar el cruzamiento , lo que permite enmascarar mutaciones recesivas nocivas. [6]