En la temporada 2005-06, Clyde compitió en su sexta temporada consecutiva en la Primera División escocesa . Graham Roberts fue designado como nuevo gerente, luego de que Billy Reid se fuera para unirse a Hamilton Academical . Roberts nombró al ex jugador del Celtic Joe Miller como su asistente.
Clyde terminó quinto en la Primera División escocesa . Salieron de la Copa de la Liga de Escocia en tercera ronda, de la Copa de Escocia en cuarta ronda y de la Copa Challenge de Escocia en primera ronda.
Fue una temporada para disfrutar para los fanáticos, ya que vieron a su equipo tomar la delantera contra el Rangers en Ibrox en la Copa de la Liga Escocesa , aunque finalmente fueron derrotados después de la prórroga . Vencieron al Celtic 2-1 en la Copa de Escocia , que fue la mayor victoria del club en años.
Nota: Las banderas indican el equipo nacional según se define en las reglas de elegibilidad de la FIFA . Los jugadores pueden tener más de una nacionalidad ajena a la FIFA.