D. Lopo de Albuquerque fue nombrado Primer Conde de Penamacor por el rey Afonso V de Portugal el 24 de agosto de 1476, por cuya carta también se entregaron al Conde las villas de Penamacor y Abiul .
D. Lopo de Albuquerque fue Lord Chambelán del Rey Afonso V, y desde 1463 fue también cetrero del rey y Capitán de la Guardia Real. Acompañó al rey Afonso V a Francia en 1477, donde había sido enviado anteriormente como embajador y fue embajador en Roma para negociar el matrimonio de Afonso V con Juana la Beltraneja , la némesis de la reina Isabel . Fue acusado de traición en 1484 por el rey Juan II y se exilió a España, donde asumió la identidad de Pedrio Nunes. Fue arrestado en Londres en 1488 a petición de Juan II y liberado en 1492 por intervención de la reina Isabel. Fue asesinado en Sevilla hacia 1492 por agentes de Juan II.
Se casó con D. Catarina de Noronha (sobrina de Filipa Moniz futura esposa de Cristóbal Colón ), hija de D. Pedro de Noronha y de Branca Dias Perestrello , hija de Bartolomeu Perestrello y su segunda esposa Branca Dias.
D. Catarina de Noronha es mencionada en la Última Voluntad de Diego Colón . Los Condes de Penamacor tuvieron los siguientes hijos:
También tuvieron un hijo adoptivo llamado Diego Méndez de Segura, quien se convirtió en secretario de Cristóbal Colón.