La Universidad EMUNI se estableció el 9 de junio de 2008 en Portorož ( Eslovenia ) con el objetivo de convertirse en una institución internacional de posgrado, educación superior e investigación, plenamente integrada en el Área Euromediterránea. Fue cofundada por cuatro universidades: Universidad de Haifa (Israel), Universidad de Maribor (Eslovenia), Universidad de Sousse (Túnez) y Universidad de Urbino "Carlo Bo" (Italia). En febrero de 2009, la Universidad EMUNI se convirtió en una entidad legal en la República de Eslovenia.
La Universidad EMUNI es una de las seis prioridades de la Unión por el Mediterráneo , cuya secretaría fue creada por la Declaración Conjunta de la Cumbre de París por el Mediterráneo.
La Universidad EMUNI tiene varias instituciones miembros, incluidas universidades y otras instituciones de educación superior e investigación de muchos países.
Las actividades de la Universidad EMUNI incluyen educación de posgrado , seminarios, conferencias (internacionales), escuelas de verano, cursos profesionales, programas de estudios de actualización profesional y otras actividades. A finales de 2008 comenzó a publicarse la Revista Internacional de Estudios Euromediterráneos (IJEMS). En 2012, IJEMS fue emitido por la editorial Springer Nature .
Las actividades de la Universidad EMUNI se centran en las áreas prioritarias de la Unión por el Mediterráneo, así como carreteras marítimas y terrestres, energías alternativas, cultura y turismo, derechos humanos y migración, protección civil, cuestiones de género, gestión del agua, política exterior, iniciativa de desarrollo empresarial y Área de investigación y educación superior euromediterránea.
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