La Copa ULEB 2006-07 fue la quinta temporada de la competición europea de baloncesto de clubes profesionales de segundo nivel , la Eurocopa . La Eurocopa de segundo nivel es el nivel de la liga europea que está un nivel por debajo del nivel de la Euroliga . Contó con 24 clubes de baloncesto, de 15 países. El Real Madrid derrotó al Lietuvos rytas en la final, por 87–75, para levantar el trofeo.
La Copa ULEB de esta temporada contó con un total de 24 equipos, divididos en cuatro grupos de seis. La fase de grupos de todos contra todos fue seguida por etapas eliminatorias. La temporada regular comenzó en octubre de 2002.
Los 24 equipos jugaron una competencia de torneo de todos contra todos (en casa y fuera). Cuatro equipos de cada grupo avanzaron a la fase eliminatoria (cuartos de final).
Los ganadores de los octavos de final avanzaron a los cuartos de final. Los partidos se jugaron a dos partidos (en casa y fuera). El ganador del partido se determinó por diferencia de puntos.
Los ganadores de los cuartos de final avanzaron a las semifinales. Los partidos se jugaron a dos partidos (en casa y fuera). El ganador del partido se determinó por diferencia de puntos.
Los ganadores de las semifinales avanzaron a la final. Los partidos se jugaron a dos partidos (en casa y fuera). El ganador del partido se determinó por diferencia de puntos.