FC Pune City (R) fue el equipo de reserva del FC Pune City que participó en la 2ª División de la I-League . FC Pune City Academy fue la configuración juvenil de FC Pune City . Participaron en la Liga Juvenil U18 y U15, así como en la Liga de Fútbol de Pune .
El 26 de agosto de 2016, se anunció que FC Pune City había comprado Pune FC Academy y la había rebautizado con su nombre. Al mismo tiempo, el equipo dio a conocer sus planes de desarrollo juvenil que incluían equipos de campo en la Liga Juvenil U18 y U15, así como la Copa Subroto y la Liga de Fútbol de Pune . [1]
FC Pune City Reserves and Academy se disolvió en 2019, poco después de que su primer equipo, FC Pune City, cerrara sus operaciones debido a dificultades financieras y técnicas. Se vendió la propiedad del club. Los derechos de franquicia fueron comprados por el empresario de TI con sede en Hyderabad, Vijay Madduri, y el ex director ejecutivo de Kerala Blasters FC , Varun Tripuneni. Posteriormente lanzaron un nuevo club, Hyderabad FC .
Nota: Las banderas indican el equipo nacional según se define en las reglas de elegibilidad de la FIFA . Los jugadores pueden tener más de una nacionalidad ajena a la FIFA.