El club fue fundado en 1949 y estaba formado por jugadores que eran nuevos inmigrantes en Israel . [1] Hapoel Jaffa jugó su primer partido el 26 de marzo de 1949, en un partido amistoso contra Hapoel HaNamal Haifa, que ganó 5-1. [2]
Hapoel jugó su primera temporada de fútbol en la Liga Meuhedet , el segundo nivel temporal en la temporada 1949-50, donde terminaron subcampeones en la división de Tel Aviv , y se colocaron en Liga Bet , el segundo nivel del fútbol israelí en ese momento. En la temporada siguiente , el club terminó último en la división Liga Bet South, con solo nueve puntos, y descendió a la Liga Gimel . En la temporada 1954-55 , el club terminó tercero en la división media, a un lugar del ascenso, y permaneció en la Liga Gimel, que se convirtió en el cuarto nivel, luego de la reestructuración del sistema de la liga de fútbol israelí.. En la misma temporada, el club tuvo una buena racha en la Copa del Estado de Israel , cuando vencieron a Shimshon Tel Aviv , Hapoel Netanya y Hapoel Be'er Ya'akov , antes de caer ante Beitar Tel Aviv en la cuarta ronda.
En la temporada 1955-1956 , el club ganó la división Dan y se clasificó para los play-offs de ascenso contra los clubes Hapoel de Lod , Holon , Ramla y Be'er Sheva . Sin embargo, el club no logró el ascenso y permaneció en la Liga Gimel.
En 1962, Hapoel no se presentó a los partidos y, como resultado, la Asociación de Fútbol de Israel lo castigó con la suspensión de actividades y finalmente se retiró. [3]