El marco de lectura alternativo de la hepatitis C stem-loop es un motivo de estructura secundaria conservado identificado en el genoma de ARN del virus de la hepatitis C (VHC) que se propone que tiene un papel importante en la regulación de la traducción y la represión del genoma viral.
La región de codificación de proteína central del genoma del virus de la hepatitis C (VHC) contiene un marco de lectura alternativo (ARF) +1 y dos estructuras de bucle de tallo formadoras de hélice de ARN filogenéticamente conservadas propuestas ( IV y VII ). [1] Las proteínas traducidas del ARF parecen traducirse durante el ciclo de vida viral normal, pero no son esenciales para la replicación del virus. [1] Se propone que los dos bucles de tallo predichos que se muestran aquí (SLV y SLVI) son importantes para la traducción y represión del VHC; estos bucles de tallo están ubicados aguas abajo del sitio de entrada del ribosoma interno (IRES), pero se desconoce su función funcional. [1]