El Consorcio Internacional de Epigenoma Humano (IHEC) es una organización científica, fundada en 2010, que ayuda a coordinar los esfuerzos globales en el campo de la Epigenómica . [1] [2] [3] [4] El objetivo inicial era generar al menos 1000 epigenomas humanos de referencia (línea de base) a partir de diferentes tipos de células humanas normales y relacionadas con enfermedades . [5] [6] [7]
Estructura y financiación
Las operaciones del IHEC están financiadas por sus miembros de pleno derecho (agencias de financiación científica nacionales y regionales), y cuentan con personal en gran parte voluntario de científicos y otros expertos de las agencias de financiación participantes y proyectos de mapeo de epigenomas. [8]
Países miembros actuales de IHEC
- Institutos Canadienses de Investigación en Salud (Canadá) [9]
- Comisión Europea (UE) [10] [11] [12] [13] [14]
- Ministerio Federal de Educación e Investigación , Agencia de Gestión de Proyectos del Centro Aeroespacial Alemán (Alemania) [15] [16]
- Instituto del Genoma de Singapur (Singapur) [17]
- Proyecto de Epigenómica de Hong Kong (Hong Kong) [18] [19]
- Agencia Japonesa de Investigación y Desarrollo Médicos (Japón) [20]
- Instituto Nacional de Salud (Corea del Sur)
- National Institutes of Health : Roadmap Epigenomics Program [21] y proyecto Encyclopedia of DNA Elements ( ENCODE ) (EE. UU.)
Además, los países y organismos que apoyan los objetivos de la IHEC son organizaciones que aún no han realizado una contribución financiera completa al proyecto, pero cuyos miembros aportan tiempo y experiencia: [22]
- Instituto Europeo de Oncología , FIRC Institute of Molecular Oncology Foundation, Instituto Italiano de Tecnología , Centro de Ciencias Genómicas (Italia)
- Agencia Nacional de Investigación (Francia)
- Consejo Nacional de Investigación Médica y de Salud (Australia)
- Reino Unido Donantes Alianza: Consejo de Investigación Médica , Biotecnología y Ciencias Biológicas de Investigación , Investigación del Cáncer del Reino Unido , y el Wellcome Trust (Reino Unido)
La supervisión de IHEC está a cargo de un Comité Ejecutivo, cuyos miembros son nominados por las organizaciones miembros de pleno derecho. [23] Este comité trabaja en estrecha colaboración con un Comité Directivo Científico Internacional, cuyos miembros son los líderes científicos de los proyectos participantes y otros líderes en el campo de la epigenética, así como un Centro de Coordinación de Datos. Los grupos de trabajo compuestos por miembros de los proyectos de investigación participantes aportan experiencia adicional.
IHEC interactúa y coordina sus esfuerzos con otros proyectos internacionales de genómica a gran escala, como el Consorcio Internacional del Genoma del Cáncer (ICGC), [24] ENCODE ., [25] [26] y la Alianza Global para la Genómica y la Salud. [27] Los miembros del comité y del grupo de trabajo, así como otras personas involucradas en IHEC, se reúnen anualmente en un evento organizado por los países miembros de forma rotatoria. [28] La mayoría de las reuniones se celebran junto con un simposio científico, algunas de las cuales están abiertas a científicos que no pertenecen al IHEC y, a veces, a miembros del público.
Metas
El objetivo final de IHEC es determinar cómo el Epigenoma ha dado forma a las poblaciones humanas a lo largo de generaciones y en respuesta al medio ambiente. [25] [29] La primera fase de las operaciones de IHEC implica coordinar la producción de al menos 1000 epigenomas de referencia a partir de células humanas sanas y enfermas, así como un número limitado de organismos modelo relevantes para enfermedades humanas específicas. El enfoque inicial está en los estados celulares, incluidos el origen, la inmortalidad, la proliferación , la diferenciación , la senescencia y el estrés. El epigenoma de referencia para cada muestra comprende mapas de alta resolución de metilación del ADN y modificaciones de histonas reguladoras clave , con la información correspondiente sobre el tipo y el nivel de expresión de todos los genes transcritos ( codificantes de proteínas y no codificantes / ARN pequeños). [30] Los datos producidos se ponen a disposición de la comunidad investigadora a través del portal de datos IHEC, [31] [32] Archivo europeo del genoma-fenoma (EGA), [33] y otros lugares. [34] [25] [35]
Además, los proyectos de investigación participantes se dedican al desarrollo de nuevos métodos epigenómicos y bioinformáticos asociados .
En noviembre de 2016, los miembros de IHEC de Canadá, el consorcio BLUEPRINT de la Unión Europea, el programa alemán de epigenoma “DEEP”, Japón, Singapur y Estados Unidos publicaron un grupo de 41 artículos coordinados en Cell Press y otras revistas. [36] [37] [38] [39] Los artículos incluían descripciones de biología molecular y métodos computacionales, así como nuevas investigaciones sobre biología normal y de enfermedades. [40] [41] [42] [43]
Ver también
- Epigenoma humano
Referencias
[44]
- ^ "Tiempo para el epigenoma: artículo: naturaleza" .
- ^ Proyecto establecido para mapear marcas en el genoma: Nature 463: 596-597 (2010) doi: 10.1038 / 463596b
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