Después de estudiar en la Academia de la Marina Helénica , Theofanidis sirvió durante la guerra greco-turca de 1897 y las guerras de los Balcanes (donde fue ayudante del comandante de la flota griega, Pavlos Kountouriotis ), y finalmente se retiró como contraalmirante en 1923.
Habiendo enseñado historia en la Academia Naval, Theofanidis se dedicó a la investigación histórica a partir de entonces, editando y publicando los archivos del tatarabuelo de su esposa, el héroe de la Revolución griega Theodoros Kolokotronis , estudios sobre la historia de la Armada griega en los períodos 1824 -26 ( Ο Αγών της Ανεξαρτησίας, Ιστορία του ελληνικού ναυτικού Σεπτέμβριος 1824 - Απρίλιος 1826. Νεόκαστρον-Καφηρεύς-Αλεξάνδρεια-Μεσολόγγιον , 1932) y 1909-1913 ( Ιστορία του Ελληνικού Ναυτικού 1909-1913: μετ'εικόνων και χαρτών , 1923) , en la caída de Napoleón después de la batalla de Waterloo ( η πτώσις του ναπολέοντος: η γαλική βουλή μετά το βατερλώ- "βελερεφόντης" - "νορθούμπερλαντ" -αγία ελένη, 1933) y sobre su campaña en Siria contra Sir Sidney Smith ( Ναπολέων - Σερ Σίδνεϋ Σμιθ , 1929).
En la década de 1920 se encontró y se obsesionó con el estudio del mecanismo de Antikythera , vendiendo propiedades familiares para financiar su investigación para reconstruir un modelo del dispositivo. Publicó un primer conjunto de sus hallazgos en 1934, pero la mayor parte de su trabajo permaneció inédito y desconocido después de su muerte. [1]
Con su esposa, Aikaterini Ioannidou, tuvo dos hijos, una hija Elli y un hijo, Iason, que también se convirtió en oficial naval.