El lago Miccosukee es un gran lago de pradera pantanosa en el norte del condado de Jefferson , Florida , ubicado al este del asentamiento de Miccosukee . Una pequeña porción del lago, su esquina noroeste, se encuentra en el condado de Leon . La pequeña ciudad de Miccosukee, Florida, está ubicada en la orilla noreste del lago en el condado de Leon.
Lake Miccosukee forma la frontera norte entre los condados de Jefferson y Leon . El lago está controlado por un sumidero activo ubicado en el extremo norte y el agua representa la superficie real del Acuífero Floridan cuando las cavernas debajo del sumidero llegan al acuífero.
El lago Miccosukee era un lago de pradera natural antes del asentamiento de los indios Miccosukee, los habitantes indígenas originales de Florida. Hace miles de años, el lago se conectaba directamente con el río St. Marks en el extremo sur. Hoy, esa conexión es subterránea y reaparece sobre el suelo en el condado de Wakulla . Las orillas del lago atrajeron a los antiguos paleoindios y posteriormente a los apalaches . Desde la década de 1830 hasta 1860, la tierra alrededor del lago fue el hogar de algunas plantaciones de algodón .
Las descripciones del lago Miccosukee han cambiado con el tiempo, particularmente en lo que respecta a la cobertura de la superficie del lago con plantas acuáticas . Al igual que el lago Lafayette y el lago Iamonia en el condado de Leon, este era un lago de pradera. En 1876, se describió que un lago Miccosukee obstruido por plantas estaba cubierto por maidencane , monocotiledóneas y bonetes blancos . En 1914, se observó una gran cantidad de agua abierta, se decía que el lago estaba cubierto de agua a una profundidad de 2 a 5 pies. El extremo sur tenía césped y arbustos de botones que sobresalían del agua. Fotografías aéreas tomadas en 1976 y 1988 muestran un lago obstruido por plantas. Solo el 19,4% del lago era agua abierta.
Alrededor de fines de la década de 1940, la cobertura de plantas acuáticas de la superficie del lago varió a medida que la cuenca se vaciaba y rellenaba periódicamente en un ciclo de 10 años. Este es un ciclo natural para los lagos de este tipo en el norte de Florida, como el lago Iamonia y el lago Jackson en el condado de Leon. A medida que la vegetación acuática volvió a crecer, más y más superficie del lago se cubrió gradualmente de vida vegetal. Una restauración más extensa podría haber creado áreas profundas dentro del lago y futuros hábitats de aguas abiertas, pero no se pudieron obtener permisos del Servicio Forestal para permitir que los incendios quemen los depósitos de estiércol dentro del lago. Existía la preocupación de que el humo de los incendios pudiera causar accidentes de tráfico en la Carretera 90 que cruza el sistema de lagos en su extremo sur.
En 1954, se construyó un dique de tierra, un aliviadero de hormigón y una puerta alrededor del sumidero para evitar que el lago se seque de forma natural, como lo había hecho en años anteriores como un lago de pradera. En el extremo sur del lago, se construyó una presa de madera para evitar que el agua desapareciera en el Lloyd Sink. Entre 1954 y 1988, el lago se estabilizó hasta el punto de que solo se drenó dos veces. La estabilización del nivel del agua acelera el proceso de envejecimiento del lago al permitir la acumulación de exceso de vida vegetal, sedimentos y lodo creado a partir de la vida vegetal moribunda. A fines de la década de 1990, el lago estaba casi completamente cubierto de vida vegetal y, en esencia, lo convirtió en un pantano bueno para caimanes y aves acuáticas, pero malo para la pesca deportiva .