Lior Samuel Pachter es biólogo computacional . Trabaja en el Instituto de Tecnología de California , donde es profesor Bren de Biología Computacional. Tiene intereses de investigación muy variados que incluyen genómica , combinatoria , geometría computacional , aprendizaje automático , computación científica y estadística . [1] [4] [5]
Lior Pachter | |
---|---|
![]() Lior Pachter en 2013 | |
Nació | Lior Samuel Pachter 3 de mayo de 1973 |
alma mater | Instituto de Tecnología de California (BS) Instituto de Tecnología de Massachusetts (PhD) |
Premios | Becario ISCB (2017) |
Carrera científica | |
Campos | Biología computacional Bioinformática Genómica Informática Matemáticas [1] |
Instituciones | Universidad de California, Berkeley |
Tesis | Azulejos de dominó, reconocimiento de genes y ratones (1999) |
Asesor de doctorado | Bonnie Berger [2] |
Estudiantes de doctorado | Cole Trapnell [2] [3] |
Sitio web | liorpachter |
Temprana edad y educación
Pachter nació en Israel y creció en Sudáfrica . [6] Obtuvo una licenciatura en matemáticas del Instituto de Tecnología de California en 1994. [4] Completó su doctorado en matemáticas en el Instituto de Tecnología de Massachusetts en 1999, supervisado por Bonnie Berger , [2] con Eric Lander y Daniel Kleitman como coasesores. [4]
Carrera e investigación
Pachter estuvo en la facultad de la Universidad de California, Berkeley de 1999 a 2018 [7] y recibió la Cátedra Sackler en 2012. [4]
Además de sus contribuciones técnicas, Pachter es conocido por usar los nuevos medios para promover la ciencia abierta [8] y por un experimento mental que publicó en su blog según el cual 'el vecino más cercano al "humano perfecto"' es de Puerto Rico. . [9] Esto recibió considerable atención de los medios, [10] y se publicó una respuesta en Scientific American . [11]
Premios y honores
En 2017, Pachter fue elegido miembro de la Sociedad Internacional de Biología Computacional (ISCB). [12]
Ver también
- TopHat (bioinformática)
- Alineación estadística rápida
Referencias
- ^ a b Publicaciones de Lior Pachter indexadas por Google Scholar
- ^ a b c Lior Pachter en el Proyecto de genealogía matemática
- ^ Trapnell, Cole; Pachter, Lior; Salzberg, Steven L. (2009). "TopHat: descubrimiento de uniones de empalme con RNA-Seq" . Bioinformática . 25 (9): 1105-1111. doi : 10.1093 / bioinformatics / btp120 . ISSN 1460-2059 . PMC 2672628 . PMID 19289445 .
- ^ a b c d Curriculum vitae: Lior Pachter (PDF) , 2017 , consultado el 16 de mayo de 2017.
- ^ Trapnell, Cole; Williams, Brian A; Pertea, Geo; Mortazavi, Ali; Kwan, Gordon; van Baren, Marijke J; Salzberg, Steven L; Wold, Barbara J; Pachter, Lior (2010). "El ensamblaje de transcripciones y la cuantificación por RNA-Seq revela transcripciones no anotadas y cambio de isoformas durante la diferenciación celular" . Biotecnología de la naturaleza . 28 (5): 511–515. doi : 10.1038 / nbt.1621 . ISSN 1087-0156 . PMC 3146043 . PMID 20436464 .
- ^ Eskenazi, Joe (14 de junio de 2002), "La petición de desinversión de la UC preocupa a los activistas pro-Israel" , Jweekly.
- ^ "UC Berkeley, Facultad del Departamento de Matemáticas, Lior Pachter" . Consultado el 8 de junio de 2019 .
- ^ Lesen, Amy E. (2015), "¿Un nuevo paradigma para la comunicación científica? Redes sociales, Twitter, ciencia y participación pública: una revisión de la literatura", en Lesen, Amy E. (ed.), Scientists, Experts y Civic Compromiso: Walking a Fine Line , Ashgate Studies in Environmental Policy and Practice, Ashgate Publishing, Ltd., págs. 111-136, ISBN 9781472415240. Véanse en particular las págs. 119-120 .
- ^ Pachter, Lior (2 de diciembre de 2014). "El humano perfecto es puertorriqueño" . Bits of DNA - Reseñas y comentarios sobre biología computacional por Lior Pachter . Consultado el 11 de diciembre de 2016 .
- ^ Valdez, Maria G. (4 de diciembre de 2014), "¡Nuevo estudio revela que el ser humano perfecto genéticamente hablando es de esta isla caribeña!" , Latin Times
- ^ Oleksyk, Taras K .; Martinez-Cruzado, Juan Carlos (5 de febrero de 2015). "Por qué no hay un ser humano perfecto en Puerto Rico o en cualquier otro lugar" . Scientific American ..
- ^ "13 de febrero de 2017: la Sociedad Internacional de Biología Computacional nombra a siete miembros como la clase de becarios de ISCB de 2017" . www.iscb.org . Consultado el 13 de febrero de 2017 .
enlaces externos
- Página web oficial
Medios relacionados con Lior Pachter en Wikimedia Commons