Juan Maldonado ( Maldonatus , Maldonation ) (1533 en Casas de Reina , Llerena , Extremadura - 5 de enero de 1583 en Roma ) fue un teólogo y exegeta jesuita español .
A los catorce o quince años fue a la Universidad de Salamanca , donde estudió latín con dos profesores ciegos, que, sin embargo, eran hombres de gran erudición. También estudió griego con Hernán Núñez (el Pinciano), filosofía con Francisco de Toledo (luego cardenal) y teología con el padre Domingo Soto.. Declaró, hasta el año 1574, que no había olvidado nada de lo que había aprendido en gramática y filosofía. Habiendo terminado su curso de tres años en el último de estos dos estudios, Maldonado se habría dedicado a la jurisprudencia con miras a los exaltados cargos de la magistratura; pero, persuadido por uno de sus compañeros de estudios, aunque para disgusto de aquellos de quienes dependía, volvió su atención a la teología, una elección de la que nunca se arrepintió. Habiendo estudiado Ciencias Sagradas durante cuatro años, y superado el examen y los ejercicios del doctorado, fue profesor de Filosofía, Teología y Griego durante algún tiempo en la Universidad de Salamanca. El registro del Colegio de la Sociedad de Salamanca indica que fue admitido allí en 1558 y enviado a Roma para ser recibido.Tomó el hábito de jesuita en el Noviciado de San Andrea, el 19 de agosto de 1562, fue ordenado sacerdote al año siguiente, y durante algunos meses escuchó casos de conciencia en el Colegio Romano.
El Colegio de Clermont que éste estuviera abierto en París, Maldonado fue enviado allí en el otoño de 1563. En febrero de 1564, comenzó una conferencia sobre Aristóteles De anima . De 1565 a 1569 impartió clases de teología. Su salud comenzó a fallar, siguió un año de descanso, durante el cual (1570) dio misiones en Poitou , donde prevalecía el calvinismo , y tuvo tanto éxito que la gente de Poitiers solicitó un colegio jesuita.
De 1570 a 1576 volvió a dar conferencias de teología, también impartió conferencias en la corte, por orden real, y llevó a cabo la conversión de varios príncipes protestantes. A instancias del duque de Montpensier , se dirigió a Sedan , para traer de vuelta al catolicismo a la duquesa de Bouillon (la hija del duque), que se había convertido en calvinista. Mantuvo, en su presencia, algunas disputas muy notables con predicadores protestantes. Durante la ausencia del provincial, también actuó durante algunos meses como viceprovincial, cuando su rectitud fue reivindicada en una acción interpuesta en su contra por los herederos del presidente de Montbrun de Saint-André, y en el caso del novicio Jannel. , quien ingresó a la Sociedad en oposición a los deseos de sus padres. El Parlamento proclamó su inocencia.
Como consecuencia de las rivalidades de los profesores de la universidad, el Papa lo asignó para enseñar teología en Toulouse, pero esto fue impedido por los calvinistas, que bloquearon los caminos que conducían allí y se retiró a Bourges para escribir su "Comentario sobre el Evangelios ". En 1578-79 fue visitante de la provincia francesa de la Compañía y luego regresó para continuar sus labores en Bourges. La provincia lo eligió, en 1580, como elector de la cuarta congregación general, en Roma, donde pronunció el discurso de apertura. Acquaviva , habiendo sido elegido general, le ordenó permanecer en Roma, y el Papa Gregorio XIII lo nombró a la comisión para revisar el texto de la Septuaginta .
En 1583, quince días antes de su muerte, cuando aún no había cumplido los cincuenta años, entregó al general sus comentarios inconclusos. Murió en Roma el 5 de enero de 1583, a los 49 años.