Malonil-CoA descarboxilasa
La malonil-CoA descarboxilasa (que también puede llamarse MCD y malonil-CoA carboxil-liasa ) se encuentra en bacterias y humanos y tiene funciones importantes en la regulación del metabolismo de los ácidos grasos y la ingesta de alimentos, y es un objetivo atractivo para el descubrimiento de fármacos. Es una enzima asociada con la deficiencia de Malonil-CoA descarboxilasa . En humanos, está codificado por el gen MLYCD.
Su función principal es catalizar la conversión de malonil-CoA en acetil-CoA y dióxido de carbono . Participa en la biosíntesis de ácidos grasos . Hasta cierto punto, invierte la acción de la Acetil-CoA carboxilasa .
MCD presenta dos isoformas que se pueden transcribir de un gen: una isoforma larga (54kDa), distribuida en mitocondrias, y una isoforma corta (49kDa) que se puede encontrar en peroxisomas y citosol. La isoforma larga incluye una secuencia de señalización hacia las mitocondrias en el extremo N-terminal; mientras que la corta solo contiene la típica secuencia de señalización peroxisomal PTS1 en el C-terminal, también compartida por la isoforma larga.
MCD es un tetrámero de proteínas , un oligómero formado por un dímero de heterodímeros relacionados por un eje de simetría binaria con un ángulo de rotación de unos 180 grados. La fuerte asimetría estructural entre los monómeros del heterodímero sugiere una reactividad de la mitad de los sitios, en la que solo la mitad de los sitios activos son funcionales simultáneamente. Cada monómero contiene básicamente dos dominios:
Sin embargo, el sitio de unión para malonil-CoA en MCD presenta una variación con respecto a sus homólogos: el centro del sitio de unión tiene un residuo glutámico en lugar de glicina, actuando como palanca molecular en la liberación del sustrato.
Como se dijo antes, MCD presenta la mitad de la reactividad de los sitios, debido a que cada heterodímero tiene dos conformaciones estructurales diferentes: estado B (unido), en el que se une el sustrato; y conformación U (no unida), donde no se permite la unión del sustrato. De acuerdo con esto, el mecanismo de la mitad de los sitios podría presentar un consumo de energía catalítica. Sin embargo, el cambio conformacional que se produce en una subunidad al pasar del estado B al estado U (que produce la liberación del producto) coincide con la formación de un nuevo sitio de unión en el sitio activo de la subunidad vecina al pasar del estado U stat al estado B. Como resultado, los cambios conformacionales sincronizados en el par de subunidades facilitan la catálisis .a pesar de la reducción del número de sitios activos disponibles.
