Después de graduarse del Programa de Artes Teatrales en George Brown College en 1989, Mahonen audicionó para una joven compañía formada para The Citadel Theatre en Edmonton. Su primer trabajo como actor profesional involucró el papel de James Keller en "The Miracle Worker", así como los papeles de Lucius y Popilious Lena en "Julius Caesar".
En 1990 Mahonen fue elegido para el papel de Gus Pike en el programa de televisión de CBC Road to Avonlea . Obtuvo tres nominaciones a los premios Gemini en 1993, 1994 y 1995 por su trabajo en la serie de televisión. En 1992, interpretó a un trompetista de jazz con Billy Dee Williams en la película Giant Steps. Luego interpretó a Lee Colgan en la miniserie de CBC Conspiracy of Silence dirigida por Frances Mankiewicz.
En 1994, Mahonen coprotagonizó con Michael Riley el especial de televisión "Los hechos detrás de los Roccamatios de Helsinki". Interpretó el personaje de Paul, un joven que muere a causa del virus del sida después de contraerlo por una transfusión de sangre unos años antes. En el verano de 1994, interpretó el papel de Jacob Mercer en "Salt Water Moon". Esto fue parte de la saga de la familia Mercer de David French ambientada en Terranova .
Mahonen también actuó como estrella invitada en numerosos proyectos de televisión estadounidenses y canadienses, incluido un episodio de Star Trek: Voyager titulado "Nemesis", en el que interpretó a un humanoide llamado "Brone". En 1997, Mahonen protagonizó "Sled" de Judith Thompson en el Tarragon Theatre de Toronto . Luego regresó al cine, coprotagonizando la película de 1998 "Captured". Continuó haciendo varias películas más, incluida "Blindness" (2008).
En 2003, Mahonen comenzó a trabajar en su primer largometraje "Sandstorm". La película involucró un drama basado en hechos sobre la persecución a los practicantes de Falun Gong en China. Escribió, dirigió y produjo la película completa por menos de $ 5,000. El elenco estaba formado por voluntarios. La película recibió 29 premios, incluidos Mejor Largometraje, Mejor Drama, Mejor Director y Mejor Guión. [1] [2]