Los estándares mínimos de información son conjuntos de pautas y formatos para informar datos derivados de métodos específicos de alto rendimiento. Su propósito es garantizar que los datos generados por estos métodos puedan ser fácilmente verificados, analizados e interpretados por la comunidad científica en general . En última instancia, facilitan la transferencia de datos de artículos de revistas (datos no estructurados) a bases de datos (datos estructurados) en una forma que permite extraer datos de múltiples conjuntos de datos. Los estándares de información mínima están disponibles para una gran variedad de tipos de experimentos, incluidos microarrays ( MIAME ), RNAseq ( MINSEQE ), metabolómica(MSI) y proteómica ( MIAPE ). [1]
Los estándares mínimos de información suelen tener dos partes. En primer lugar, hay un conjunto de requisitos de presentación de informes, que normalmente se presentan como una tabla o una lista de verificación. En segundo lugar, hay un formato de datos. La información sobre un experimento debe convertirse al formato de datos adecuado para que se envíe a la base de datos correspondiente. En el caso de MIAME , el formato de datos se proporciona en formato de hoja de cálculo (MAGE-TAB). Algunas de las comunidades que mantienen estándares mínimos de información también brindan herramientas para ayudar a los investigadores experimentales a anotar sus datos. [1]
Los estándares mínimos individuales de información son aportados por las comunidades de especialistas interdisciplinarios enfocados en la problemática del método específico utilizado en biología experimental. Luego, los estándares brindan especificaciones sobre qué información sobre los experimentos ( metadatos ) es crucial e importante para informar junto con los datos resultantes para que sea integral. [2] [3] La necesidad de esta estandarización está impulsada en gran medida por el desarrollo de métodos experimentales de alto rendimiento que proporcionan enormes cantidades de datos. El desarrollo de estándares mínimos de información de diferentes métodos está siendo armonizado desde 2008 por el proyecto "Información mínima sobre una investigación biomédica o biológica" (MIBBI). [4]
MIAPPE es un proyecto abierto impulsado por la comunidad para armonizar los datos de los experimentos de fenotipado de plantas. MIAPPE comprende una lista de verificación conceptual de los metadatos necesarios para describir adecuadamente un experimento de fenotipado de plantas.
Publicadas en 2009, estas pautas para la base de los requisitos de muchas revistas al enviar datos de QPCR, lamentablemente no se cumplen lo suficiente. [5]
Información mínima sobre un experimento de microarrays (MIAME) [3] describe la información mínima sobre un experimento de microarrays que se necesita para permitir la interpretación de los resultados del experimento sin ambigüedades y potencialmente para reproducir el experimento y tiene como objetivo facilitar la difusión de datos de experimentos de micromatrices. Fue publicado por la Sociedad FGED en 2001 y fue el primer estándar de información mínima publicado para experimentos de alto rendimiento en las ciencias de la vida.