A principios de 910, el hermano de Muhammad, el Saffarid amir al-Layth b. 'Ali , dirigió un ejército hacia el oeste hacia Fars en un esfuerzo por arrebatárselo a su gobernante, el comandante esclavo Sebük-eri . Dado que tanto al-Layth como otro hermano, al-Mu'addal , participaban en la campaña, Muhammad se quedó atrás en la capital, Zarang, como representante de al-Layth. La campaña terminó en un desastre, con la captura de al-Layth y enviado a la corte abasí en Bagdad.; cuando la noticia de esto llegó a Zarang a principios de septiembre, Muhammad fue aclamado como emir en las provincias que todavía formaban parte del amirato. Para cimentar su poder, encarceló a al-Mu'addal, quien había logrado evitar ser capturado por Sebük-eri y había regresado a Sistan .
Poco después de su ascensión, Muhammad se vio obligado a lidiar con los samánidas bajo Ahmad , a quien recientemente se le había otorgado un diploma califal para Sistán y sus territorios subordinados en un esfuerzo por romper el poder de los saffaríes de una vez por todas. En respuesta al aumento de fuerzas de Ahmad en Herat , Mahoma formó un ejército él mismo. Debido a limitaciones financieras, gran parte del ejército estaba formado por campesinos. Se dirigió al norte hacia la frontera y tuvo algunos enfrentamientos menores con los samánidas en marzo de 911. Sin embargo, finalmente fue derrotado y el contingente de campesinos huyó, lo que lo obligó a abandonar la expedición.
En este punto, sus asesores convencieron a Mahoma de que necesitaba el apoyo de al-Mu'addal, que todavía estaba en prisión. Después de su liberación, al-Mu'addal tomó el control de Zarang, por lo que Muhammad se dirigió a Bust. Aquí había comenzado una revuelta debido a los impuestos excesivos por parte de las autoridades saffaríes. Fue dirigido por un Ibrahim b. Yusuf-al'Arif, quien declaró su lealtad a los samánidas. Un ejército avanzado de Saffarid tuvo dificultades para sofocar la revuelta hasta que Ibrahim desapareció repentinamente en la batalla, lo que permitió a los Saffarid retomar el control de Bust.
Muhammad poco después entró en Busto, pero él mismo utilizó métodos violentamente opresivos en un intento desesperado por recaudar dinero. Como resultado, los ciudadanos de Bust se volvieron hostiles a los Saffarids, y cuando Samanid Ahmad llegó antes de la ciudad, lo ayudaron a tomarla. Muhammad huyó, pero pronto fue capturado y devuelto a Bust. En respuesta a la solicitud del califa, Ahmad envió a Muhammad a Bagdad. Su captura, junto con la rendición de al-Mu'addal a otro ejército de Samanid, permitió a los Samanids tomar brevemente el control de Sistan.