Murdoch MacKinnon (15 de marzo de 1865 - 12 de octubre de 1944) fue un político canadiense y se desempeñó como el undécimo vicegobernador de la Isla del Príncipe Eduardo .
MacKinnon nació en Brooklyn, Isla del Príncipe Eduardo de padres de ascendencia escocesa , Lauchlin MacKinnon y Mary MacDonald. Recibió su educación superior en el Prince of Wales College y luego se convirtió en agricultor. El 21 de octubre de 1914 se casó con Perle Beecher Taylor y juntos tuvieron un hijo.
En las Elecciones Generales del 28 de julio de 1897, MacKinnon fue elegido para representar al Partido Conservador en el 4º Distrito de Kings en la Legislatura Provincial. Desde ese momento hasta las elecciones generales de 1919, MacKinnon fue reelegido continuamente y retuvo su escaño en la Legislatura. Entre 1911 y 1919 se desempeñó como Comisionado de Agricultura y Secretario Tesorero Provincial en el gabinete provincial.
El 8 de septiembre de 1919, Murdoch MacKinnon fue nombrado vicegobernador de la Isla del Príncipe Eduardo y se desempeñó en ese cargo hasta 1924. Es mejor conocido por hacer historia constitucional en la provincia en 1923 por rechazar su asentimiento al proyecto de ley Church Union . Murió en Charlottetown.