El Centro de Bioinformática de los Países Bajos o NBIC [1] (2003-2013) fue una organización holandesa financiada por el gobierno que coordinó todo el trabajo académico sobre bioinformática en los Países Bajos . [2] NBIC consistió en programas de investigación (BioRange), de educación (BioWise) y de apoyo (BioAssist). Los socios de NBIC son todas las universidades y hospitales universitarios holandeses , y algunas entidades comerciales. La oficina central de NBIC fue alojada por el Centro de Informática Molecular y Biomolecular (CMBI) en el Centro Médico de la Universidad Radboud de Nijmegen .
Tipo | organización sin fines de lucro |
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Localización | |
Sitio web | www.nbic.nl |
Historia
En 2003 se lanzó NBIC [3] como una organización sin fines de lucro, para fortalecer y organizar la investigación bioinformática en los Países Bajos . NBIC es uno de los cuatro centros tecnológicos habilitadores que fueron iniciados por la Iniciativa de Genómica de los Países Bajos (NGI) [4] para mejorar la investigación basada en la genómica en los Países Bajos. Los otros tres centros tecnológicos son: el Centro de Proteómica de los Países Bajos (NPC), [5] el Centro de Metabolómica de los Países Bajos (NMC) [6] y el Consorcio de Biología de Sistemas de los Países Bajos (NCSB). [7] La mayoría de los servicios se trasladaron al Techcentre holandés de ciencias biológicas en 2015. [8]
Fondos
El Centro de Bioinformática de los Países Bajos fue financiado por el gobierno holandés a través de la Iniciativa de Genómica de los Países Bajos (NGI) [9] y el programa BSIK [10] (infraestructuras de conocimiento).
Apoyo
El departamento de soporte de NBIC, BioAssist, está formado por grupos de trabajo que reúnen a expertos en los diferentes campos de la bioinformática. Juntas, estas personas identifican problemas comunes en su campo que se propusieron resolver de manera colaborativa. BioAssist también tiene un grupo, BioInformatics Research Support (BRS), [11] [12] que ayuda a los profesionales médicos y biológicos con proyectos breves de bioinformática.
Educación
La parte de educación de NBIC, BioWise, organiza cursos y capacitaciones en diferentes niveles. Proporcionan formación en sensibilización en las escuelas, [13] colaboran con los diferentes programas de educación en bioinformática en las universidades de los Países Bajos y organizan cursos de formación para estudiantes de doctorado . Además, se organizan capacitaciones y conferencias sobre temas específicos, ya sea a nivel nacional o con otros socios internacionales como el Instituto Suizo de Bioinformática .
Logros
Organización de la investigación en bioinformática
Hasta ahora, NBIC ha logrado su objetivo de reunir a los diferentes grupos de investigación en bioinformática de los Países Bajos . Ahora también se está asociando con universidades holandesas de Ciencias Aplicadas (UAS) en la red LOBIN. en julio de 2011 se han incorporado cuatro UAS. [14]
Software de bioinformática
Las personas involucradas en NBIC han creado una amplia variedad de software bioinformático . [15] NBIC también alberga un servicio para coordinar el desarrollo de software (servidor Trac con versiones de software y documentación del proyecto). [16] Muchas herramientas también están disponibles a través del propio servidor Galaxy abierto de NBIC [17]
Enlaces industriales
Se han dado los primeros pasos para incluir entidades comerciales, entre otras a través de la Plataforma de Usuarios Industriales de Bioinformática (BIUP). La BIUP, aunque todavía está en su fase de puesta en marcha a mediados de 2011, ya ha atraído socios como DSM .
Construcción comunitaria
Una gran parte de los esfuerzos de NBIC se centra en el desarrollo de comunidades bioinformáticas nuevas o en el fortalecimiento de las existentes. Por ejemplo, NBIC organizó la Conferencia Comunitaria Galaxy 2011 . [18] La Plataforma de Bioinformática para la Proteómica de los Países Bajos (para abreviar NBPP) es una iniciativa conjunta del Centro de Bioinformática de los Países Bajos (NBIC) y el Centro de Proteómica de los Países Bajos (NPC).
La reunión inaugural de la Organización Mundial para el Aprendizaje, la Educación y la Formación en Bioinformática (GOBLET) se celebró en el NBIC en noviembre de 2012. [19]
Referencias
- ^ Sitio web de NBIC
- ^ van Gelder, Celia WG; Hooft, Rob WW; van Rijswijk, Merlijn N .; van den Berg, Linda; Kok, Ruben G .; Reinders, Marcel; Mons, Barend; Heringa, Jaap (15 de septiembre de 2017). "Bioinformática en los Países Bajos: el valor de una comunidad nacional" . Sesiones informativas en bioinformática . 20 (2): 375–383. doi : 10.1093 / bib / bbx087 . PMC 6433734 . PMID 28968694 .
- ^ Información de la iniciativa de genómica de los Países Bajos en NBIC
- ^ Descripción general de los centros de genómica NGI
- ^ Sitio web Centro de proteómica de los Países Bajos
- ^ Sitio web Centro de metabolómica de los Países Bajos
- ^ "Sitio web del Consorcio Holandés de Biología de Sistemas" . Archivado desde el original el 25 de enero de 2012 . Consultado el 27 de febrero de 2012 .
- ^ "NBIC: las actividades de BioAssist se trasladaron al programa DTL Data" . www.nbic.nl . Consultado el 2 de marzo de 2018 .
- ^ Página web Iniciativa de Genómica de Países Bajos
- ^ Sitio web BSIK: Besluit subsidios Investeringen Kennisinfrastructuur
- ^ [1]
- ^ http://www.nbic.nl/support/brs/
- ^ Bioinformática en de klas
- ^ Miembros de LOBIN
- ^ lista de productos de software clave de NBIC
- ^ Servidor de trac NBIC
- ^ Servidor Galaxy NBIC
- ^ Página de inicio de Galaxy Community Conference 2011
- ^ "Reunión BTN / GOBLET | GOBLET" . www.mygoblet.org . Consultado el 24 de agosto de 2016 .