OpenEpi es una serie de programas gratuitos , basados en la web, de código abierto e independientes del sistema operativo para su uso en epidemiología , bioestadística , salud pública y medicina , que proporciona una serie de herramientas epidemiológicas y estadísticas para datos resumidos. [1] [2] [3] [4] [5] [6] [7] [8] [9] [10] [11] OpenEpi se desarrolló en JavaScript y HTML , y se puede ejecutar en navegadores web modernos.. El programa se puede ejecutar desde el sitio web de OpenEpi o descargar y ejecutar sin una conexión web. El código fuente y la documentación se pueden descargar y están disponibles gratuitamente para su uso por otros investigadores. OpenEpi ha sido revisado, tanto por organizaciones de medios como en revistas de investigación. [12] [13] [14] [15] [16]
Desarrollador (es) | AG Dean, KM Sullivan, MM Soe |
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Lanzamiento estable | 3.03 / 22 de septiembre de 2014 |
Sistema operativo | Multiplataforma |
Plataforma | HTML , JavaScript |
Tipo | Aplicación web , Análisis estadístico |
Licencia | Licencia MIT |
Sitio web | www |
Los desarrolladores de OpenEpi han tenido una amplia experiencia en el desarrollo y las pruebas de Epi Info , un programa desarrollado por los Centros para el Control y la Prevención de Enfermedades (CDC) y ampliamente utilizado en todo el mundo para la entrada y el análisis de datos. OpenEpi se desarrolló para realizar análisis que se encuentran en la versión DOS de los módulos Epi Info StatCalc y EpiTable, para mejorar los tipos de análisis proporcionados por estos módulos y para proporcionar una serie de herramientas y cálculos que actualmente no están disponibles en Epi Info. Es el primer paso hacia un conjunto de herramientas de software epidemiológico totalmente basadas en la web. OpenEpi puede considerarse un complemento importante de Epi Info y de otros programas como SAS , PSPP , SPSS , Stata , SYSTAT , Minitab , Epidata y R (consulte el lenguaje de programación R ). Otro programa basado en Windows funcionalmente similar es Winpepi . Consulte también la lista de paquetes estadísticos y la comparación de paquetes estadísticos . Tanto OpenEpi como Epi Info se desarrollaron con el objetivo de proporcionar herramientas para áreas del mundo con recursos bajos y moderados. El desarrollo inicial de OpenEpi fue apoyado por una subvención de la Fundación Bill y Melinda Gates a la Universidad de Emory . [17]
Los tipos de cálculos realizados actualmente por OpenEpi incluyen:
- Varios intervalos de confianza para proporciones, tasas, razón de mortalidad estandarizada , media , mediana , percentiles
- Tablas crudas y estratificadas 2x2 para datos de recuento y tasa
- Análisis de casos y controles emparejados
- Prueba de tendencia con datos de recuento
- Prueba t independiente y ANOVA unidireccional
- Análisis de pruebas de diagnóstico y detección con curvas de características operativas del receptor (ROC)
- Tamaño de la muestra para las proporciones, en sección transversal encuestas, sin igual de casos y controles , cohorte , ensayos controlados aleatorios , y la comparación de dos medios
- Cálculos de potencia para las proporciones ( casos y controles no emparejados , de corte transversal , de cohorte, ensayos controlados aleatorios ) y para la comparación de dos medias.
- Generador de números aleatorios
Para los epidemiólogos y otros investigadores de la salud, OpenEpi realiza una serie de cálculos basados en tablas que no se encuentran en la mayoría de los paquetes epidemiológicos y estadísticos. Por ejemplo, para una sola tabla de 2x2, además de los resultados presentados en otros programas, OpenEpi proporciona estimaciones para:
- Fracción etiológica o prevenida en la población y en los expuestos con intervalos de confianza, basados en datos de riesgo, probabilidades o tasas
- La estimación de la razón de posibilidades entre productos y MLE
- Valores p exactos de p mid-p y límites de confianza para la razón de posibilidades
- Cálculos de ratios de tasas y diferencias de tasas con intervalos de confianza y pruebas estadísticas.
Para tablas 2x2 estratificadas con datos de recuento, OpenEpi proporciona:
- Mantel-Haenszel (MH) y estimaciones basadas en precisión de la razón de riesgo y la razón de probabilidades
- Diferencia de riesgo ajustada basada en precisión
- Pruebas de interacción para el índice de riesgo , el índice de probabilidades y la diferencia de riesgo.
- Cuatro métodos de límite de confianza diferentes para la razón de posibilidades.
Al igual que en Epi Info, en un análisis estratificado, se proporcionan estimaciones tanto brutas como ajustadas para poder realizar la evaluación de los factores de confusión . Con datos de tasas, OpenEpi proporciona relaciones de tasas ajustadas y diferencias de tasas, y pruebas de interacción . Finalmente, con los datos de recuento, OpenEpi también realiza una prueba de tendencia, tanto para datos crudos como estratificados.
Además de ser utilizado para analizar datos por investigadores de salud, OpenEpi se ha utilizado como una herramienta de capacitación para enseñar epidemiología a estudiantes en: Emory University, University of Massachusetts, University of Michigan, University of Minnesota, Morehouse College, Columbia University, University of Wisconsin, Universidad Estatal de San José, Universidad de Medicina y Odontología de Nueva Jersey, Universidad de Washington y otros lugares. Esto incluye cursos de aprendizaje a distancia y en el campus. Debido a que OpenEpi es fácil de usar, no requiere experiencia en programación y se puede ejecutar en Internet, los estudiantes pueden usar el programa y concentrarse en la interpretación de los resultados. Los usuarios pueden ejecutar el programa en inglés, francés, español, portugués o italiano.
Los comentarios y sugerencias de mejoras son bienvenidos y los desarrolladores responden a las consultas de los usuarios. Los desarrolladores animan a otros a desarrollar módulos que podrían agregarse a OpenEpi y proporcionan una herramienta para desarrolladores en el sitio web. El desarrollo futuro planificado incluye mejoras a los módulos existentes, desarrollo de nuevos módulos, traducción a otros idiomas y agrega la capacidad de cortar y pegar datos y / o leer archivos de datos.
Ver también
- Simulación basada en web
- Software estadístico gratuito
Referencias
- ^ Sullivan KM, Dean A, Soe MM (2009). "OpenEpi - una calculadora epidemiológica y estadística basada en la web para la salud pública". Informes de salud pública (124): 471–474. PMID 19445426 .
- ^ Sullivan K .; Abramson J. (julio de 2008). "Actualización de software epidemiológico gratuito". El Monitor de Epidemiología . 29 (7): 3–4.
- ^ Sullivan, K. (primavera-verano de 2008). "Foco de la facultad". La Vanguardia Epi .
- ^ Sullivan, KM (diciembre de 2007). "OpenEpi ahora está disponible en inglés, francés, italiano y español". El Monitor de Epidemiología . 28 (14).
- ^ Sullivan KM, Dean A, Soe MM (mayo de 2007). "OpenEpi Versión 2". El Monitor de Epidemiología . 28 (5): 1, 9-10.
- ^ Sullivan, KM (abril de 2007). "Descripción general del software analítico gratuito para epidemiólogos". El Monitor de Epidemiología . 28 (4).
- ^ Sullivan, KM (primavera de 2007). "OpenEpi - una calculadora basada en web". La Vanguardia Epi .
- ^ Sullivan K, Dean A, Soe MM (junio de 2006). "OpenEpi: una actualización". El Monitor de Epidemiología . 27 (6): 4.
- ^ Sullivan KM, Dean AG, Mir R (abril de 2004). "OpenEpi: un nuevo esfuerzo colaborativo en informática epidemiológica". El Monitor de Epidemiología . 25 (4): 3, 7, 9.
- ^ Sullivan KM, Dean AG, Mir R (11 a 14 de junio de 2003). OpenEpi: un nuevo esfuerzo colaborativo en computación epidemiológica . 36ª Reunión Anual de la Sociedad de Investigaciones Epidemiológicas. Atlanta, GA , Estados Unidos.
- ^ Dean AG, Sullivan KM, Mir R (1 a 4 de octubre de 2003). La iniciativa Open Epi: software de navegador web de código abierto para la salud pública . Reunión Científica Anual de la Asociación Epidemiológica Internacional. Toledo, España : Federación Europea de Epidemiología.
- ^ OpenEpi online «Tecnología, salud y desarrollo
- ^ Grandes herramientas gratuitas para enseñar estadística | Educación TI | ZDNet.com
- ^ Antoch, J. (2008). "Entorno para la computación estadística". Revisión de Ciencias de la Computación . 2 (2): 113–122. doi : 10.1016 / j.cosrev.2008.05.002 .
- ^ Abramson JH, Abramson ZH (2008). 6ta (ed.). Métodos de investigación en medicina comunitaria: encuestas, investigación epidemiológica, evaluación de programas, ensayos clínicos . John Wiley e hijos.
- ^ Singh, S. (2009). "Revisión de freewares de entrada y análisis de epidatos" . Revista india de medicina comunitaria (34): 76–7. PMC 2763648 .
- ^ "Copia archivada" (PDF) . Archivado desde el original (PDF) el 20 de septiembre de 2009 . Consultado el 22 de septiembre de 2009 .CS1 maint: copia archivada como título ( enlace )
enlaces externos
- Página web oficial