Función de partición para ARN interactivos


La función de partición para ARN interactivos ( piRNA ) es un paquete paralelo de C ++ para calcular funciones de partición conjuntas e individuales para dos secuencias de ARN. A partir de las funciones de partición, piRNA calcula las concentraciones de equilibrio de especies simples y dobles, la energía del conjunto, las temperaturas de fusión y las probabilidades de los pares de bases. piRNA es parte del paquete de software TaveRNA RNA.

El algoritmo piRNA se ha publicado en Bioinformatics 25(12):i365-i373; doi : 10.1093/bioinformatics/btp212 PMID 19478011 . [1]