PABPC1


1CVJ , 1G9L , 1JGN , 1JH4 , 2K8G , 2RQG , 2RQH , 2X04 , 3KTP , 3KTR , 3KUI , 3KUJ , 3KUR , 3KUS , 3KUT , 3PKN , 3PTH , 4F02 , 4F25 , 4F26 , 5DX1 , 5DXA , 5DX8 , 2D9P

La proteína de unión a poliadenilato 1 es una proteína que en humanos está codificada por el gen PABPC1 . [5] La proteína PABP1 se une al ARNm y facilita una variedad de funciones, como el transporte dentro y fuera del núcleo, la degradación, la traducción y la estabilidad. Hay dos proteínas PABP1 separadas, una que se encuentra en el núcleo (PABPN1) y la otra que se encuentra en el citoplasma (PABPC1). La ubicación de PABP1 afecta el papel de esa proteína y su función con el ARN. [6]

La proteína de unión a poli(A) (PAB o PABP), que se encuentra complejada con la cola poli(A) 3' del ARNm eucariótico, es necesaria para el alargamiento de poli(A) y la terminación de la traducción. En humanos, las PABP comprenden una pequeña isoforma nuclear y una familia de genes conservados de otras proteínas de unión a poli(A) . [suministrado por OMIM] [7]

PABPC1 generalmente se difunde dentro del citoplasma y se concentra en sitios de alta concentración de ARNm, como gránulos de estrés, cuerpos de procesamiento y ubicaciones de alta actividad de traducción. PABPC1 también está asociado con la descomposición del ARNm mediada por tonterías (NMD). PABPC1 se une a la cola poli(A) e interactúa con eIF4G, que estabiliza la circularización de los ARNm. Esta estructura es necesaria para la prevención de la degradación del ARNm a través de NMD. [8]

En el núcleo, PABP1 se une a las colas poli(A) de los pre-ARNm para facilitar la estabilidad, la exportación, el transporte y la degradación. También se requiere la unión a PABP1 para la degradación mediada por energía nuclear. PABPC1 contiene cuatro motivos de reconocimiento de ARN (RRM). Los dos primeros, RRM1 y RRM2, se unen tanto a la α-importina como a la cola poli(A) del ARNm procesado. Esta característica evita que el ARNm regrese al núcleo. [6]

1jgn : estructura de la solución del dominio PABC C-terminal de la proteína de unión a poli(A) humana en complejo con el péptido de Paip2