El río Quilacoya está ubicado en la comuna de Hualqui de la provincia de Concepción de Chile . Tiene recorrido de unos 40 kilómetros con un pequeño caudal. Tiene su origen en la vertiente sur de la serie de alturas de Lucay que corren de este a oeste en la parte sur de la comuna de Florida . Corre hacia el suroeste para unirse al río Bío Bío en la margen norte a nueve kilómetros sobre el poblado de Hualqui .
El río Quillacoya fue la ubicación del rehue Moluche de Quillacoya dentro del aillarehue de Hualqui . En la parte alta del río se une el riachuelo Millahue y otros pequeños arroyos en los que el gobernador Pedro de Valdivia descubrió en 1552 ricas minas de oro aluvial . El gobernador formó allí una mina en octubre de 1553 con gran número de trabajadores mapuche , quienes la abandonaron inmediatamente después de su muerte a fines de ese año. El funcionamiento de estas minas se reanudó más tarde, pero poco después se agotaron. El nombre Quilacoya deriva del mapudungun para tres coyán, formado por quyla , "tres", y de coyán , el nombre Moluche para el Nothofagus obliqua .