El híbrido de radiación reducida es un procedimiento para descubrir la ubicación de los marcadores genéticos entre sí. La ubicación relativa de estos marcadores se puede combinar en un mapa físico o un mapa genético . La técnica de radiación híbrida comienza como otra forma de amplificar y purificar el ADN , el primer paso en cualquier proyecto de secuenciación; se usa radiación para romper el ADN en pedazos y estos pedazos se incorporan a la célula híbrida; el híbrido se puede cultivar en grandes cantidades. Luego, se puede verificar la presencia de varios marcadores genéticos mediante PCR y análisis de ligamiento para resolver la distancia entre los marcadores. Es decir, si dos marcadores genéticosestán cerca unos de otros, es menos probable que se separen por la radiación que rompe el ADN. La técnica es similar al análisis de ligamiento tradicional, donde dependemos de la recombinación genética para calcular la distancia entre dos marcadores genéticos.
El procedimiento utiliza dos líneas celulares, ninguna de las cuales puede sobrevivir en medios tóxicos, pero contienen genes que pueden resistir la toxina cuando están contenidas en la misma célula. La línea celular en estudio se irradia, provocando roturas en el ADN. Estas células se fusionan con la otra línea celular, produciendo un híbrido. Si el híbrido incorpora genes de ambas células, podrá sobrevivir en el medio tóxico.
Las células que sobreviven se pueden cultivar en grandes cantidades, amplificando así el ADN que se incorporó de la línea celular irradiada. Se puede preparar una muestra de ADN de la línea celular híbrida y usar PCR para amplificar dos marcadores genéticos específicos. Al ejecutar los productos de PCR en un gel, se puede determinar si ambos marcadores están en la línea celular. Si ambos marcadores suelen estar en el híbrido, podemos concluir que están cerca uno del otro.