El dominio RhoGEF describe dos dominios estructurales distintos con actividad del factor de intercambio de nucleótidos de guanina (GEF) para regular las pequeñas GTPasas de la familia Rho . Rho pequeñas GTPasas son inactivas cuando se unen a GDP pero activas cuando se unen a GTP ; Los dominios RhoGEF en proteínas pueden promover la liberación de GDP y la unión de GTP para activar miembros específicos de la familia Rho, incluidos RhoA , Rac1 y Cdc42 .
Dominio DH / PH RhoGEF | ||||||||||
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Identificadores | ||||||||||
Símbolo | RhoGEF | |||||||||
Pfam | PF00621 | |||||||||
InterPro | IPR035899 IPR000219, IPR035899 | |||||||||
INTELIGENTE | RhoGEF | |||||||||
SCOP2 | 1dbh / SCOPe / SUPFAM | |||||||||
Proteína OPM | 1xd4 | |||||||||
CDD | cd00160 | |||||||||
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Dedicador de citocinesis (DOCK) Dominio RhoGEF | ||||||||||
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Identificadores | ||||||||||
Símbolo | RhoGEF | |||||||||
Pfam | PF06920 | |||||||||
InterPro | IPR010703 IPR026791, IPR010703 | |||||||||
SCOP2 | 1wg7 / SCOPe / SUPFAM | |||||||||
CDD | cd11684 | |||||||||
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La clase más grande de RhoGEF se compone de proteínas que contienen el dominio de "homología Dbl " ( DH ), que casi siempre se encuentra junto con un dominio de homología de pleckstrina (PH) para formar una estructura de dominio DH / PH combinada. [2] [3]
Una clase distinta de RhoGEF son las proteínas que contienen el dominio DOCK / CZH / DHR-2 . Esta estructura no tiene similitud de secuencia con los dominios de homología DBL. [4]
Proteínas humanas que contienen dominio DH / PH RhoGEF
ABR ; AKAP13 / ARHGEF13 / Lbc ; ALS2 ; ALS2CL ; ARHGEF1 / p115-RhoGEF ; ARHGEF10 ; ARHGEF10L ; ARHGEF11 / PDZ-RhoGEF. ; ARHGEF12 / LARG ; ARHGEF15 ; ARHGEF16 ; ARHGEF17 ; ARHGEF18 ; ARHGEF19 ; ARHGEF2 ; ARHGEF25 ; ARHGEF26 ; ARHGEF28 ; ARHGEF3 ; ARHGEF33 ; ARHGEF35 ; ARHGEF37 ; ARHGEF38 ; ARHGEF39 ; ARHGEF4 ; ARHGEF40 ; ARHGEF5 ; ARHGEF6 / alpha-PIX ; ARHGEF7 / beta-PIX ; ARHGEF9 ; BCR ; DNMBP ; ECT2 ; ECT2L ; FARP1 ; FARP2 ; FGD1 ; FGD2 ; FGD3 ; FGD4 ; FGD5 ; FGD6 ; ITSN1 / Intersectina 1 ; ITSN2 / Intersectin 2 ; KALRN / Kalirin ; MCF2 ; MCF2L ; MCF2L2 ; NET1 ; NGEF ; OBSCN ; PLEKHG1 ; PLEKHG2 ; PLEKHG3 ; PLEKHG4 ; PLEKHG4B ; PLEKHG5 ; PLEKHG6 ; PREX1 ; PREX2 ; RASGRF1 ; RASGRF2 ; SPATA13 ; TIAM1 ; TIAM2 ; TRIO ; VAV1 ; VAV2 ; VAV3 .
Proteínas humanas que contienen dominio DOCK / CZH RhoGEF
DOCK1 / DOCK180 ; DOCK2 ; DOCK3 / MOCA ; DOCK4 ; DOCK5 ; DOCK6 / ZIR1 ; DOCK7 / ZIR2 ; DOCK8 / ZIR3 ; DOCK9 / Zizimin1 ; DOCK10 / Zizimin2 ; DOCK11 / Zizimin3
Ver también
- GTPasa
- Pequeña GTPasa
- Factor de intercambio de nucleótidos de guanina
- Familia Rho de GTPasas
Referencias
- ^ Soisson SM, Nimnual AS, Uy M, Bar-Sagi D, Kuriyan J (octubre de 1998). "Estructura cristalina de los dominios de homología Dbl y pleckstrin de la proteína humana Son of sevenless" . Celular . 95 (2): 259–68. doi : 10.1016 / S0092-8674 (00) 81756-0 . PMID 9790532 . S2CID 11868669 .
- ^ Fort P, Blangy A (junio de 2017). "El paisaje evolutivo de familias RhoGEF similares a Dbl: adaptación de células eucariotas a señales ambientales" . Biología y evolución del genoma . 9 (6): 1471-1486. doi : 10.1093 / gbe / evx100 . PMC 5499878 . PMID 28541439 .
- ^ Cerione RA, Zheng Y (abril de 1996). "La familia de oncogenes Dbl". Opinión actual en biología celular . 8 (2): 216-22. doi : 10.1016 / s0955-0674 (96) 80068-8 . PMID 8791419 .
- ^ Côté JF, Vuori K (diciembre de 2002). "Identificación de una superfamilia conservada evolutivamente de proteínas relacionadas con DOCK180 con actividad de intercambio de nucleótidos de guanina" . Revista de ciencia celular . 115 (Pt 24): 4901-13. doi : 10.1242 / jcs.00219 . PMID 12432077 .
Otras lecturas
- Hart MJ, Eva A, Evans T, Aaronson SA, Cerione RA (noviembre de 1991). "Catálisis del intercambio de nucleótidos de guanina en la proteína CDC42Hs por el producto oncogénico dbl". Naturaleza . 354 (6351): 311–4. doi : 10.1038 / 354311a0 . PMID 1956381 . S2CID 4240053 .
- Tan EC, Leung T, Manser E, Lim L (diciembre de 1993). "El gen relacionado con la región del clúster de punto de ruptura activo humano codifica una proteína cerebral con homología con las proteínas de intercambio de nucleótidos de guanina y las proteínas activadoras de GTPasa". La revista de química biológica . 268 (36): 27291–8. PMID 8262969 .
- Soisson SM, Nimnual AS, Uy M, Bar-Sagi D, Kuriyan J (octubre de 1998). "Estructura cristalina de los dominios de homología Dbl y pleckstrin de la proteína humana Son of sevenless" . Celular . 95 (2): 259–68. doi : 10.1016 / S0092-8674 (00) 81756-0 . PMID 9790532 . S2CID 11868669 .