Rui Fernandes (nacido el 16 de marzo de 1971) es un piragüista de velocidad portugués que compitió a principios y mediados de la década de 1990. Fue eliminado en las semifinales del evento K-4 1000 m en los Juegos Olímpicos de Verano de 1992 en Barcelona . Cuatro años después en Atlanta , Fernandes fue eliminado en las semifinales de tanto el K-2 500 m los y K-2 1000 m eventos.