Sec61

Sec61 , denominado SecYEG en procariotas, es un complejo de proteínas de membrana que se encuentra en todos los dominios de la vida. Como componente central del translocón , transporta proteínas al retículo endoplásmico en eucariotas y fuera de la célula en procariotas. Es un poro en forma de rosquilla a través de la membrana con 3 subunidades diferentes (heterotrimérica), SecY (α), SecE (γ) y SecG (β). Tiene una región llamada tapón que bloquea el transporte dentro o fuera de la sala de emergencias. Este tapón se desplaza cuando la región hidrófoba de un polipéptido naciente interactúa con otra región de Sec61 llamada costura, lo que permite la translocación del polipéptido en la luz del RE. ^[1]

Estructura

Estructura de rayos X de la arquea SecYEβ ( PDB : 1RHZ ).

Vista lateral (transmembrana)

Subunidades: SecY (rojo), SecE (verde), Secβ (azul)

Gran parte del conocimiento sobre la estructura del poro SecY / Sec61α proviene de una estructura de cristalografía de rayos X de su versión arqueal . ^[2]La gran subunidad SecY consta de dos mitades, segmentos transmembrana 1-5 y segmentos transmembrana 6-10. Están unidas en el lado extracelular por un bucle entre los segmentos transmembrana 5 y 6. SecY puede abrirse lateralmente en la parte delantera (puerta lateral). SecE es una proteína de membrana de expansión única en la mayoría de las especies. Se encuentra en la parte posterior de SecY, envolviendo las dos mitades de SecY. Secβ (SecG) no es esencial. Se encuentra en el lateral de SecY y solo hace unos pocos contactos con él. En una vista lateral, el canal tiene forma de reloj de arena, con un embudo citoplasmático que está vacío y un embudo extracelular que se llena con una pequeña hélice, llamada tapón. En el medio de la membrana hay una construcción, formada por un anillo de poros de aminoácidos hidrofóbicos.que proyectan sus cadenas laterales hacia adentro. Durante la translocación de proteínas, el tapón se aparta y una cadena polipeptídica se mueve desde el embudo citoplasmático, a través del anillo poroso, el embudo extracelular, hacia el espacio extracelular. Los segmentos hidrófobos de las proteínas de membrana salen lateralmente a través de la puerta lateral hacia la fase lipídica y se convierten en segmentos que atraviesan la membrana. ^[2]

Por taxón

El canal SecYEG bacteriano interactúa con las secuencias señal de proteínas secretoras, así como con SecA , una ATPasa que impulsa la translocación. SecY es una proteína integral de la membrana de la membrana plasmática de 419 a 492 residuos de aminoácidos que normalmente contiene 10 regiones transmembrana (TM), 6 citoplasmáticas y 5 periplásmicas. ^[3]

En lugar de SecA, el translocón eucariota puede utilizar el biP del chaperón ER-lumenal para impulsar la translocación. ^{[ cita requerida ]}

El translocón archaeal es menos conocido. Podría usar SecDF - YajC y YidC como bacterias, ya que se han encontrado homólogos. Aún no se ha identificado una ATPasa. ^[4]

Específicos de la especie

Proteínas humanas:

SecY: SEC61A1 , SEC61A2
SecG: SEC61B
SecE: SEC61G

La levadura en ciernes tiene dos complejos homólogos de este tipo ; el esencial se llama Sec61 y el no esencial se llama Ssh1. Como Sec61, Ssh1 se acopla al ribosoma. ^[5]

Ver también

Proteína SecY
Translocón
Orientación a proteínas

Referencias

^ Osborne AR, Rapoport TA, van den Berg B (2005). "Translocación de proteínas por el canal Sec61 / SecY". Revisión anual de biología celular y del desarrollo . 21 : 529–50. doi : 10.1146 / annurev.cellbio.21.012704.133214 . PMID 16212506 .
^ a b Van den Berg B, Clemons WM, Collinson I, Modis Y, Hartmann E, Harrison SC, Rapoport TA (enero de 2004). "Estructura de rayos X de un canal conductor de proteínas". Naturaleza . 427 (6969): 36–44. Código Bibliográfico : 2004Natur.427 ... 36B . doi : 10.1038 / nature02218 . PMID 14661030 . S2CID 4360143 .
^ Ito K (septiembre de 1992). "SecY y componentes integrales de la membrana del sistema de translocación de proteínas de Escherichia coli" . Microbiología molecular . 6 (17): 2423–8. doi : 10.1111 / j.1365-2958.1992.tb01417.x . PMID 1406280 .
^ Calo, D; Eichler, J (marzo de 2011). "Cruzando la membrana en Archaea, el tercer dominio de la vida" . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranas . 1808 (3): 885–91. doi : 10.1016 / j.bbamem.2010.03.020 . PMID 20347718 .
^ Harty C, Römisch K (marzo de 2013). "Análisis de interacciones Sec61p y Ssh1p en la membrana ER utilizando el sistema split-ubiquitina" . Biología celular BMC . 14 : 14. doi : 10.1186 / 1471-2121-14-14 . PMC 3618304 . PMID 23497013 .

Alberts, Bruce y col. Biología molecular de la célula. Garland, 2002. ISBN 0-8153-3218-1

enlaces externos

Proteína SEC61 + en los encabezados de temas médicos (MeSH) de la Biblioteca Nacional de Medicina de EE. UU .

[pmid16212506-1] Osborne AR, Rapoport TA, van den Berg B (2005). "Translocación de proteínas por el canal Sec61 / SecY". Revisión anual de biología celular y del desarrollo . 21 : 529–50. doi : 10.1146 / annurev.cellbio.21.012704.133214 . PMID 16212506 .

[VandenBerg-2] Van den Berg B, Clemons WM, Collinson I, Modis Y, Hartmann E, Harrison SC, Rapoport TA (enero de 2004). "Estructura de rayos X de un canal conductor de proteínas". Naturaleza . 427 (6969): 36–44. Código Bibliográfico : 2004Natur.427 ... 36B . doi : 10.1038 / nature02218 . PMID 14661030 . S2CID 4360143 .

[PUB00003823-3] Ito K (septiembre de 1992). "SecY y componentes integrales de la membrana del sistema de translocación de proteínas de Escherichia coli" . Microbiología molecular . 6 (17): 2423–8. doi : 10.1111 / j.1365-2958.1992.tb01417.x . PMID 1406280 .

[4] Calo, D; Eichler, J (marzo de 2011). "Cruzando la membrana en Archaea, el tercer dominio de la vida" . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembranas . 1808 (3): 885–91. doi : 10.1016 / j.bbamem.2010.03.020 . PMID 20347718 .

[5] Harty C, Römisch K (marzo de 2013). "Análisis de interacciones Sec61p y Ssh1p en la membrana ER utilizando el sistema split-ubiquitina" . Biología celular BMC . 14 : 14. doi : 10.1186 / 1471-2121-14-14 . PMC 3618304 . PMID 23497013 .

[1]