De Wikipedia, la enciclopedia libre
Ir a navegaciónSaltar a buscar
Corporación de códigos genéticos
EscribePrivada
IndustriaBioinformática e Ingeniería
Fundado1988
SedeAnn Arbor, MI, EE. UU.
Gente claveHoward Cash
Presidente y director ejecutivo [1]
ProductosHerramientas de análisis de secuencia de ADN
Sitio webwww .genecodes .com

Gene Codes Corporation es una empresa internacional de propiedad privada con sede en Ann Arbor, Michigan , que se especializa en software bioinformático para el análisis de secuencias genéticas . Su producto de software insignia, Sequencher, es un software de secuenciación utilizado en todo el mundo. Su uso específico es para investigadores de laboratorios académicos y gubernamentales, así como empresas de biotecnología y farmacéuticas para el ensamblaje de secuencias de ADN.

Historia

Gene Codes Corporation fue fundada en 1988 en Ann Arbor, Michigan. En 1991, se lanzó el software de análisis y ensamblaje de secuencias de ADN, Sequencher. En 1997, casi todas las principales empresas farmacéuticas y empresas comerciales de genómica del mundo estaban estandarizadas en Sequencher, así como la mayoría de los laboratorios de los principales centros académicos. Sequencher 5.4 fue lanzado en 2015. [2]

Secuenciador

Sequencher 5.1 tiene la capacidad de realizar secuenciación de Sanger y secuenciación de próxima generación. Tiene herramientas avanzadas que ayudan en el análisis general de secuencias y crean informes que son un análisis en profundidad dentro del conjunto de datos del cliente.

Analisis general
  • Alineación de secuencia de referencia
  • Tabla de varianza
  • Amplias capacidades de importación y exportación
  • Búsqueda de NCBI BLAST
Secuenciación de Sanger
  • Importar datos de cualquiera de los principales instrumentos de CE
  • Limpiar datos sin procesar recortando vectores bases de baja calidad
  • Realice una alineación de novo o un ensamblaje basado en referencias con
  • Muévase fácilmente entre archivos de datos alineados y analice los rastros a nivel local o global para encontrar picos secundarios o no llamados.
  • Muévase instantáneamente entre la traducción de múltiples cuadros de secuencia sin procesar y los mapas de restricción
  • Configure plantillas reutilizables para proyectos comunes que le permitan usar la numeración base y las características de la secuencia de referencia para anotar nuevas alineaciones.
  • Compare proyectos similares usando una tabla de variaciones
  • Herramientas avanzadas y potentes para detectar mutaciones y SNP y consultar datos sin procesar para eliminar los artefactos de secuenciación.
  • Genere informes que documenten rápida y claramente los resultados de la investigación.
Secuenciación de próxima generación
  • Importe fácilmente lecturas NGS
  • Elija Maq o GSNAP como su algoritmo de alineación
  • Ver resultados usando la tableta
  • Análisis de SNP y estudios de metilación

Premios

  • La Sociedad Internacional de Biología Computacional reconoce a Howard Cash y Gene Codes Forensics por la aplicación única de la biología computacional para ayudar con la identificación de víctimas de desastres. El presidente de ISCB, Michael Gribskov, calificó la contribución de Gene Codes como "única, valiosa y más allá del límite de lo que podría esperarse".
  • Ann Arbor IT Zone reconoce a Gene Codes Corporation con el Indestructible Award for Growth and Achievement.
  • Gene Codes recibe el premio Merlanti a las mejores prácticas en ética empresarial.
  • Genome Technology convierte a Howard Cash [ enlace muerto permanente ] en la Persona del año en sus premios All-Star.
  • Gene Codes Corporation es nombrada una de las Future 50 of Greater Detroit: "En reconocimiento a su destacada contribución al Metropolitan Detroit a través del crecimiento de las ventas y el empleo".
  • Ernst & Young y The New Enterprise Forum nombran a Howard Cash, presidente, director ejecutivo y fundador de Gene Codes, empresario del año.
  • Gene Codes gana el premio Fast Track del condado de Washtenaw.
  • Sequencher recibe el Mejor Producto de Ensamblaje de Secuencias de ADN del Biotechnology Software & Internet Journal.
  • Gene Codes recibe el premio Michigan Leading Edge Technology Award en la categoría de biotecnología. El premio reconoce las innovaciones introducidas con Sequencher versión 3.0, dando una mención especial a las mejoras que permitieron una mayor automatización de procesos.
  • Gene Codes recibe el premio a la Mejor Presentación del Año otorgado por la sucursal de Michigan del New Enterprise Forum: "En reconocimiento a una empresa comercial innovadora que ha ayudado a hacer de Gene Codes Corporation una empresa empresarial modelo".

Referencias

  1. ^ Página de apreciación de códigos genéticos , sitio web de Jonathan Hoyle
  2. ^ Gene Codes lanza Sequencher 5.4, software de análisis de secuencia de ADN , 10 de noviembre de 2015 10:00 a.m., hora estándar del este, BUSINESS WIRE
  • Thomas D. Wu y Serban Nacu, Detección rápida y tolerante a SNP de variantes complejas y empalme en lecturas cortas, Bioinformatics 2010 26: 873-881
  • Heng Li, Jue Ruan y Richard Durbin, Mapeo de lecturas cortas de secuenciación de ADN y variantes de llamada utilizando puntuaciones de calidad de mapeo, Genome Research 2008 18: 1851-1858
  • Ian Milne, Micha Bayer, Linda Cardle, Paul Shaw, Gordon Stephen, Frank Wright y David Marshall, Visualización de ensamblaje de secuencias de próxima generación de tabletas, BioInformatics 2010 26: 40-402

Enlaces externos