Steven A. Benner
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Steven Albert Benner
Nació( 23/10/1954 )23 de octubre de 1954 (66 años) [1]
NacionalidadEstados Unidos
alma materUniversidad de Yale Universidad de
Harvard
Carrera científica
Los camposQuímica , biología sintética
InstitucionesUniversidad de Harvard
ETH Zurich
University of Florida , Foundation for Applied Molecular Evolution
Asesor de doctoradoRobert Burns Woodward y Frank Westheimer
Sitio webwww.ffame.org

Steven Albert Benner (nacido el 23 de octubre de 1954) ha sido profesor en la Universidad de Harvard , ETH Zurich y la Universidad de Florida, donde fue Profesor Distinguido de Química VT & Louise Jackson. En 2005, fundó el Instituto de Ciencia y Tecnología Westheimer (TWIST) y la Fundación para la Evolución Molecular Aplicada. Benner también ha fundado las empresas EraGen Biosciences y Firebird BioMolecular Sciences LLC.

Benner y sus colegas fueron los primeros en sintetizar un gen, iniciando el campo de la biología sintética . Jugó un papel decisivo en el establecimiento del campo de la paleogenética . Está interesado en el origen de la vida y las condiciones químicas y los procesos necesarios para producir ARN . Benner ha trabajado con la NASA para desarrollar detectores de materiales genéticos extraterrestres, utilizando la definición de vida desarrollada por el Grupo de Trabajo de Disciplina de Exobiología de la NASA en 1992, "un sistema químico autosuficiente capaz de la evolución darwiniana". [2] [3] [4] [5]

Educación

Benner asistió a la Universidad de Yale , donde recibió su BS / MS en biofísica molecular y bioquímica en 1976. Luego fue a la Universidad de Harvard , recibiendo su Ph.D. en química en 1979. [6] Trabajó bajo la supervisión de Robert Burns Woodward , completando su trabajo de tesis con Frank Westheimer después de la muerte de Woodward. Su Ph.D. La tesis fue estereoquímica absoluta de acetoacetato descarboxilasa, betaína-homocisteína transmetilasa y 3-hidroxibutirato deshidrogenasa. [7]

Carrera profesional

Después de graduarse de la Universidad de Harvard , Benner se convirtió en miembro de Harvard, recibiendo el Premio Dreyfus para jóvenes profesores en 1982. Fue profesor asistente en el Departamento de Química de la Universidad de Harvard de 1982 a 1986. [8]

En 1986, Benner se mudó a ETH Zurich , el Instituto Federal Suizo de Tecnología en Zurich. [9] Ocupó los cargos de profesor asociado de química bioorgánica de 1986 a 1993 y profesor de química bioorgánica de 1993 a 1996. [8]

En 1996 [10] Benner se unió a la facultad de la Universidad de Florida , como profesor de química y biología celular y molecular. Fue nombrado Profesor Distinguido de Química VT & Louise Jackson en el Departamento de Química de la Universidad de Florida en 2004. [11]

Benner dejó la Universidad de Florida a fines de diciembre de 2005 para fundar el Instituto de Ciencia y Tecnología Westheimer (TWIST) en honor a Frank Westheimer . Es parte de la Fundación para la Evolución Molecular Aplicada (FfAME) en Alachua, Florida , que Benner fundó en 2001. [12]

Benner fundó EraGen Biosciences en 1999. Luminex adquirió la empresa en 2011. [13] [14] Fundó Firebird BioMolecular Sciences LLC en 2005. [12] [15] [16]

Investigar

La investigación de Benner se divide en cuatro áreas principales:

  1. expandiendo el alfabeto genético sintetizando estructuras artificiales
  2. química prebiótica, la recreación del origen químico de la vida
  3. paleogenética, el estudio de proteínas antiguas de especies extintas hace mucho tiempo
  4. detección de vida extraterrestre [17]

El laboratorio Benner es un creador del campo de la " biología sintética ", que busca generar, mediante síntesis química , moléculas que reproduzcan el comportamiento complejo de los sistemas vivos, incluida su genética, herencia y evolución. A continuación se enumeran algunos puntos destacados de trabajos anteriores en genética química.

Síntesis de genes

En 1984, el laboratorio de Benner en Harvard fue el primero en informar sobre la síntesis química de un gen que codifica una enzima, [18] [19] [20] después de la síntesis de Khorana de un gen más corto para tRNA en 1970. [21] Este fue el primero gen diseñado de cualquier tipo, un logro pionero que sentó las bases para la ingeniería de proteínas . [22] Las estrategias de diseño introducidas en esta síntesis ahora se utilizan ampliamente para apoyar la ingeniería de proteínas. [23]

Sistemas genéticos artificiales

Benner y sus colaboradores informaron por primera vez de los esfuerzos hacia el objetivo de los sistemas genéticos artificiales en 1989, cuando desarrollaron el primer par de bases no naturales . [24] [25] [26] [27] Benner y sus colegas han desarrollado desde entonces un sistema de información genética expandido artificialmente de seis letras llamado Sistema de Información Genética Expandido Artificialmente (AEGIS) que incluye dos nucleótidos no estándar adicionales (Z y P) además a los cuatro nucleótidos estándar (G, A, C y T). [28] [29] [30] [31] AEGIS tiene su propia biología molecular de apoyo. [5]Permite la síntesis de proteínas con más de los 20 aminoácidos codificados naturalmente y proporciona información sobre cómo los ácidos nucleicos forman estructuras dúplex, cómo las proteínas interactúan con los ácidos nucleicos [32] y cómo podrían aparecer sistemas genéticos alternativos en la vida no terrestre. . [33]

Benner es uno de varios investigadores, incluidos Eric T. Kool, Floyd E. Romesberg, Ichiro Hirao, Mitsuhiko Shionoya y Andrew Ellington, que han creado un alfabeto extendido de bases sintéticas que pueden incorporarse al ADN (así como al ARN). utilizando la unión de Watson-Crick (así como la unión que no es de Watson-Crick). Si bien la mayoría de estas bases sintéticas son derivados de las bases A, C, G, T, algunas son diferentes. Mientras que algunos están en pares Watson-Crick (A / T, C / G), algunos se complementan a sí mismos (X / X). Por tanto, el alfabeto genético se ha ampliado. [15] [25] [27] [34] [35] [36] [37] [38] : 88–98 

El número de posibles tripletes de nucleótidos, o codones , disponibles en la síntesis de proteínas depende del número de nucleótidos disponibles. El alfabeto estándar (G, A, C y T) produce 4 3 = 64 codones posibles, mientras que un alfabeto de ADN expandido con 9 bases de ADN tendría 9 3 = 729 codones posibles, muchos de ellos codones sintéticos. Para que estos codones sean útiles, Aminoacil tRNA sintetasase ha creado de manera que el ARNt pueda codificar el aminoácido posiblemente sintético que se va a acoplar con su correspondiente anticodón sintético. Brenner ha descrito un sistema de este tipo que usa ADN sintético iso-C / iso-G que usa el codón de ADN sintético [iso-C / A / G] que él llama el codón 65. El ARNm sintético con anti-codón sintético [iso-G / U / C] con aminoacil-ARNt sintetasa sintética da como resultado un experimento in vivo que puede codificar un aminoácido sintético incorporado en polipéptidos sintéticos ( proteómica sintética ). [38] : 100–106 

Un modelo de "segunda generación" para ácidos nucleicos

Benner ha utilizado la química orgánica sintética y la biofísica para crear un modelo de "segunda generación" para la estructura del ácido nucleico. El modelo de ADN de primera generación fue propuesto por James Watson y Francis Crick , basado en estructuras de rayos X cristalizadas que está estudiando Rosalind Franklin . Según el modelo de doble hélice , el ADN está compuesto por dos hebras complementarias de nucleótidos enrolladas entre sí. [39] El modelo de Benner enfatiza el papel de la columna vertebral de azúcar y fosfato en el evento de reconocimiento molecular genético. La columna vertebral polianiónica es importante para crear la estructura extendida que ayuda a que el ADN se replique. [40] [41] [42]

En 2004, Benner informó sobre el primer intento exitoso de diseñar una molécula artificial similar al ADN capaz de reproducirse a sí misma. [22]

Secuenciación del genoma y predicción de la estructura de proteínas.

A finales de la década de 1980, Benner reconoció el potencial de los proyectos de secuenciación del genoma para generar millones de secuencias y permitir a los investigadores realizar un extenso mapeo de estructuras moleculares en química orgánica. A principios de la década de 1990, Benner conoció a Gaston Gonnet , comenzando una colaboración que aplicó las herramientas de Gonnet para la búsqueda de texto a la gestión de secuencias de proteínas. [43] [44] En 1990, en colaboración con Gaston Gonnet, el laboratorio Benner presentó el banco de trabajo de bioinformática DARWIN. DARWIN (Análisis y recuperación de datos con secuencias de ácido nucleico-péptido indexadas) fue un entorno de programación de alto nivel para examinar secuencias genómicas. Apoyó el emparejamiento de secuencias genómicas en bases de datos y generó información que mostraba cómo las proteínas naturales podían evolucionar de manera divergente bajo restricciones funcionales mediante la acumulación de mutaciones, inserciones y deleciones. [45] Sobre la base de Darwin, el laboratorio Benner proporcionó herramientas para predecir la estructura tridimensional de las proteínas a partir de datos de secuencia. La información sobre estructuras proteicas conocidas fue recopilada y comercializada como una base de datos comercial, el Catálogo Maestro, por la startup EraGen de Benner. [45]

El uso de información de secuencia múltiple para predecir la estructura secundaria de proteínas se hizo popular como resultado del trabajo de Benner y Gerloff. [46] [47] [48] ​​Las predicciones de la estructura secundaria de las proteínas de Benner y sus colegas lograron una alta precisión. [49] Se hizo posible modelar los pliegues de proteínas, detectar homólogos distantes, habilitar la genómica estructural y unir la secuencia, estructura y función de las proteínas. Además, este trabajo sugirió límites para estructurar la predicción por homología, definiendo lo que se puede y no se puede hacer con esta estrategia. [45]

Herramientas prácticas de genotipado

El enfoque de Benner abrió nuevas perspectivas sobre cómo funcionan los ácidos nucleicos, así como herramientas para el diagnóstico y la nanotecnología. La FDA ha aprobado productos que utilizan el ADN de AEGIS en el diagnóstico humano. Estos controlan las cargas de virus en pacientes infectados con hepatitis B , hepatitis C y VIH . [50] AEGIS ha sido la base del desarrollo de herramientas para la detección multiplexada de marcadores genéticos como células cancerosas [51] y polimorfismos de un solo nucleótido en muestras de pacientes. Estas herramientas permitirán la medicina personalizada utilizando análisis genéticos "en el punto de atención ", [52]así como herramientas de investigación que miden el nivel de moléculas de ARNm individuales dentro de procesos individuales de neuronas vivas individuales. [53]

Proteómica interpretativa

Interpretando datos genómicos y proyectando hacia un ancestro genético común, "Luca", el laboratorio Benner ha introducido herramientas que analizan patrones de conservación y variación usando biología estructural, estudian la variación en estos patrones en diferentes ramas de un árbol evolutivo y correlacionan eventos en el registro genético con eventos en la historia de la biosfera conocidos a partir de geología y fósiles. De esto han surgido ejemplos que muestran cómo los roles de las biomoléculas en la vida contemporánea pueden entenderse a través de modelos del pasado histórico. [54] [55]

Paleogenética experimental

Más información: resurrección de genes ancestrales

Benner fue un creador del campo de la paleogenética experimental , donde los genes y proteínas de organismos antiguos resucitan mediante la bioinformática y la tecnología del ADN recombinante. [56] El trabajo experimental en proteínas antiguas ha probado hipótesis sobre la evolución de funciones biológicas complejas, incluida la bioquímica de la digestión de los rumiantes, [57] [58] : 209  la termofilia de bacterias antiguas y la interacción entre plantas, frutas y hongos en el momento de la extinción del Cretácico . [58] : 17 Estos desarrollan nuestra comprensión del comportamiento biológico que se extiende desde la molécula hasta la célula, el organismo, el ecosistema y el planeta, lo que a veces se denomina biología planetaria. [58] : 221 

Astrobiología

Benner está profundamente interesado en el origen de la vida y las condiciones necesarias para respaldar un modelo de mundo de ARN en el que el ARN autorreplicante es un precursor de la vida en la Tierra. Ha identificado el calcio , el borato y el molibdeno como importantes para la formación exitosa de carbohidratos y la estabilización del ARN. [59] Él sugirió que el planeta Marte puede haber tenido condiciones más deseables que la Tierra para la producción inicial de ARN, [60] [61] pero más recientemente acordó que los modelos de la Tierra primitiva que muestran tierra seca y agua intermitente, desarrollados por Stephen Mojzsis , presentan condiciones suficientes para el desarrollo de ARN.[12]

El grupo Benner ha trabajado para identificar estructuras moleculares que probablemente sean características universales de los sistemas vivos independientemente de su génesis, y no probablemente productos de procesos no biológicos. Se trata de " biofirmas ", tanto para la vida terrestre como para las formas de vida "extrañas". [3] [62] [63]

Referencias

  1. ^ "Benner, Steven A. (Steven Albert), 1954-" . Registros de la Autoridad de la Biblioteca del Congreso . Consultado el 30 de junio de 2016 .
  2. ^ Mullen, Leslie (1 de agosto de 2013). "Definición de la vida: preguntas y respuestas con el científico Gerald Joyce" . Revista de Astrobiología . Consultado el 5 de julio de 2016 .
  3. ↑ a b Benner, Steven A. (diciembre de 2010). "Definiendo la vida" . Astrobiología . 10 (10): 1021–1030. Código Bibliográfico : 2010AsBio..10.1021B . doi : 10.1089 / ast.2010.0524 . PMC 3005285 . PMID 21162682 .  
  4. ^ Klotz, Irene (27 de febrero de 2009). "La forma de vida sintética crece en el laboratorio de Florida" . Ciencia . Consultado el 5 de julio de 2016 .
  5. ↑ a b Lloyd, Robin (14 de febrero de 2009). "Nuevos puntos de ADN artificial para la vida alienígena" . LiveScience . Consultado el 5 de julio de 2016 .
  6. ^ Impey, Chris Impey; Spitz, Anna H .; Stoeger, William, eds. (2013). Encuentro con la vida en el universo: fundamentos éticos e implicaciones sociales de la astrobiología . Tucson: Prensa de la Universidad de Arizona. pag. 259. ISBN 978-0-8165-2870-7. Consultado el 30 de junio de 2016 .
  7. ^ "Steven A. Benner" . Árbol de química . Consultado el 30 de junio de 2016 .
  8. ^ a b "Eventos en Rice" . Universidad de Rice . Archivado desde el original el 19 de septiembre de 2016 . Consultado el 1 de julio de 2016 .
  9. ^ Kwok, Roberta (21 de noviembre de 2012). "Biología química: nuevo alfabeto del ADN" . Naturaleza . 491 (7425): 516–518. Código bibliográfico : 2012Natur.491..516K . doi : 10.1038 / 491516a . PMID 23172197 . 
  10. ^ Benner, Steven A. "Pares de bases no estándar como herramientas de investigación biomédica" . Grantome . Consultado el 1 de julio de 2016 .
  11. ^ "Participantes" . La iniciativa del enfoque humilde . Consultado el 1 de julio de 2016 .
  12. ↑ a b c Clark, Anthony (24 de marzo de 2016). "Equipo local para encabezar la búsqueda de $ 5,4 millones para estudiar los orígenes de la vida en la Tierra" . El sol de Gainesville . Consultado el 30 de junio de 2016 .
  13. ^ Wyzan, Andrew (12 de julio de 2011). "La antigua biotecnología de Gainesville se vendió por $ 34 millones" . El sol de Gainesville . Consultado el 1 de julio de 2016 .
  14. ^ Carroll, John. "Luminex compra EraGen Biosciences en un acuerdo de $ 34 millones" . Fierce Biotech . Consultado el 22 de junio de 2011 .
  15. ↑ a b Howgego, Josh (25 de febrero de 2014). "Sobre nucleótidos extraños" . Mundo de la química . Consultado el 1 de julio de 2016 .
  16. ^ "Firebird BioMolecular Sciences LLC" .
  17. ^ "Coloquio del sueño del presidente" . Universidad Simon Fraser . Consultado el 1 de julio de 2016 .
  18. ^ Gross, Michael (agosto de 2011). "¿Qué es exactamente la biología sintética?" . Biología actual . 21 (16): R611 – R614. doi : 10.1016 / j.cub.2011.08.002 .
  19. ^ Nambiar, K .; Stackhouse, J; Stauffer, D .; Kennedy, W .; Eldredge, J .; Benner, S. (23 de marzo de 1984). "Síntesis total y clonación de un gen que codifica la proteína ribonucleasa S" (PDF) . Ciencia . 223 (4642): 1299–1301. Código Bibliográfico : 1984Sci ... 223.1299N . doi : 10.1126 / science.6322300 . PMID 6322300 . Consultado el 5 de julio de 2016 .  
  20. ^ D'Alessio, Giuseppe; Riordan, James F. (1997). Estructuras y funciones de las ribonucleasas . San Diego: Prensa académica. pag. 214. ISBN 9780125889452. Consultado el 5 de julio de 2016 .
  21. ^ Khorana, HG; Agarwal, KL; Büchi, H .; Caruthers, MH; Gupta, NK; Klbppe, K .; Kumar, A .; Ohtsuka, E .; RajBhandary, UL; van de Sande, JH; Sgaramella, V .; Tebao, T .; Weber, H .; Yamada, T. (diciembre de 1972). "CIII. Síntesis total del gen estructural para un ácido ribonucleico de transferencia de alanina de levadura". Revista de Biología Molecular . 72 (2): 209–217. doi : 10.1016 / 0022-2836 (72) 90146-5 . PMID 4571075 . 
  22. ↑ a b Gramling, Carolyn (2005). "Para el profesor de química Steven Benner, la vida tal como la conocemos puede no ser la única alternativa" . Ciencia asombrosa . 10 (1) . Consultado el 9 de julio de 2016 .
  23. ^ Köhrer, Caroline; RajBhandary, Uttam L., eds. (2009). Ingeniería de proteínas . Berlín: Springer. págs. 274–281, 297. ISBN 978-3-540-70941-1. Consultado el 5 de julio de 2016 .
  24. ^ Fikes, Bradley J. (8 de mayo de 2014). "Vida diseñada con código genético expandido" . Tribuna de la Unión de San Diego . Consultado el 5 de julio de 2016 .
  25. ^ a b Matsuda, Shigeo; Fillo, Jeremiah D .; Henry, Allison A .; Rai, Priyamrada; Wilkens, Steven J .; Dwyer, Tammy J .; Geierstanger, Bernhard H .; Wemmer, David E .; Schultz, Peter G .; Spraggon, Glen; Romesberg, Floyd E. (agosto de 2007). "Esfuerzos hacia la expansión del alfabeto genético: estructura y replicación de pares de bases no naturales" . Revista de la Sociedad Química Estadounidense . 129 (34): 10466–10473. doi : 10.1021 / ja072276d . PMC 2536688 . PMID 17685517 .  
  26. ^ Switzer, Christopher; Moroney, Simon E .; Benner, Steven A. (octubre de 1989). "Incorporación enzimática de un nuevo par de bases en ADN y ARN". Revista de la Sociedad Química Estadounidense . 111 (21): 8322–8323. doi : 10.1021 / ja00203a067 .
  27. ^ a b Piccirilli, Joseph A .; Benner, Steven A .; Krauch, Tilman; Moroney, SimonE .; Benner, Steven A. (4 de enero de 1990). "La incorporación enzimática de un nuevo par de bases en el ADN y el ARN amplía el alfabeto genético". Naturaleza . 343 (6253): 33–37. Bibcode : 1990Natur.343 ... 33P . doi : 10.1038 / 343033a0 . PMID 1688644 . S2CID 4363955 .  
  28. ^ Benner, SA; Hutter, D; Sismour, AM (2003). "Biología sintética con sistemas de información genética expandidos artificialmente. De la medicina personalizada a la vida extraterrestre". Investigación de ácidos nucleicos. Suplemento . 3 (3): 125–6. doi : 10.1093 / nass / 3.1.125 . PMID 14510412 . 
  29. ^ Yang, Z; Hutter, D; Sheng, P; Sismour, AM; Benner, SA (2006). "Sistema de información genética expandido artificialmente: un nuevo par de bases con un patrón alternativo de enlace de hidrógeno" . Investigación de ácidos nucleicos . 34 (21): 6095–101. doi : 10.1093 / nar / gkl633 . PMC 1635279 . PMID 17074747 .  
  30. ^ Yang, Zunyi; Chen, Fei; Alvarado, J. Brian; Benner, Steven A. (28 de septiembre de 2011). "Amplificación, mutación y secuenciación de un sistema genético sintético de seis letras" . Revista de la Sociedad Química Estadounidense . 133 (38): 15105–15112. doi : 10.1021 / ja204910n . PMC 3427765 . PMID 21842904 .  
  31. ^ Merritt, Kristen K; Bradley, Kevin M; Hutter, Daniel; Matsuura, Mariko F; Rowold, Diane J; Benner, Steven A (9 de octubre de 2014). "Ensamblaje autónomo de oligonucleótidos sintéticos construidos a partir de un alfabeto de ADN expandido. Síntesis total de un gen que codifica la resistencia a la kanamicina" . Revista Beilstein de Química Orgánica . 10 : 2348-2360. doi : 10.3762 / bjoc.10.245 . PMC 4222377 . PMID 25383105 .  
  32. ^ Laos, Roberto; Thomson, J. Michael; Benner, Steven A. (31 de octubre de 2014). "ADN polimerasas diseñadas por evolución dirigida para incorporar nucleótidos no estándar" . Fronteras en microbiología . 5 : 565. doi : 10.3389 / fmicb.2014.00565 . PMC 4215692 . PMID 25400626 .  
  33. ^ Comité sobre los límites de la vida orgánica en sistemas planetarios, Comité sobre los orígenes y la evolución de la vida; Junta de Estudios Espaciales, División de Ingeniería y Ciencias Físicas; Junta de Ciencias de la Vida, División de Ciencias de la Tierra y de la Vida; Consejo Nacional de Investigaciones de las Academias Nacionales (2007). "4. Alternativas a la bioquímica terrestre en el agua" . Los límites de la vida orgánica en los sistemas planetarios . Washington, DC: Prensa de las Academias Nacionales. ISBN 978-0-309-10484-5.CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  34. ^ Pollack, Andrew (24 de julio de 2001). "Los científicos están empezando a agregar letras al alfabeto de la vida" . The New York Times . Consultado el 30 de junio de 2016 .
  35. ^ Singer, Emily (10 de julio de 2015). "Nuevas letras añadidas al alfabeto genético" . Revista Quanta . Consultado el 30 de junio de 2016 .
  36. ^ Switzer, CY; Moroney, SE; Benner, SA (5 de octubre de 1993). "Reconocimiento enzimático del par de bases entre isocitidina e isoguanosina". Bioquímica . 32 (39): 10489–96. CiteSeerX 10.1.1.690.1426 . doi : 10.1021 / bi00090a027 . PMID 7691174 .  
  37. ^ Takezawa, Yusuke; Shionoya, Mitsuhiko (18 de diciembre de 2012). "Emparejamiento de bases de ADN mediadas por metales: alternativas a los pares de bases de Watson-Crick enlazados por hidrógeno". Cuentas de Investigación Química . 45 (12): 2066–2076. doi : 10.1021 / ar200313h . PMID 22452649 . 
  38. ↑ a b Simon, Matthew (2005). Computación emergente con énfasis en bioinformática . Nueva York: AIP Press / Springer Science + Business Media. ISBN 978-0-387-27270-2.
  39. ^ Watson JD, Crick FH (1953). "La estructura del ADN". Arb de resorte frío. Symp. Quant. Biol . 18 : 123–31. doi : 10.1101 / SQB.1953.018.01.020 . PMID 13168976 . 
  40. ^ Comité sobre los límites de la vida orgánica en sistemas planetarios, Comité sobre los orígenes y la evolución de la vida; Junta de Estudios Espaciales, División de Ingeniería y Ciencias Físicas; Junta de Ciencias de la Vida, División de Ciencias de la Tierra y de la Vida; Consejo Nacional de Investigaciones de las Academias Nacionales (2007). "4. Alternativas a la bioquímica terrestre en el agua" . Los límites de la vida orgánica en los sistemas planetarios . Washington, DC: Prensa de las Academias Nacionales. ISBN 978-0-309-10484-5.CS1 maint: varios nombres: lista de autores ( enlace )
  41. ^ Benner, Steven (2004). "Análisis del genoma basado en la evolución: una alternativa para analizar el plegamiento y la función de las proteínas" . En Westhof, E .; Hardy, N. (eds.). Plegado y autoensamblaje de biológicas y macromoléculas: actas de los deuxièmes Entretiens de Bures, Bures-sur-Yvette, Francia, 27 de noviembre - 1 de diciembre de 2001 . Singapur: World Scientific. págs. 1-42. ISBN 978-981-238-500-0. Consultado el 6 de julio de 2016 .
  42. ^ Benner, Steven A .; Hutter, Daniel (febrero de 2002). "Fosfatos, ADN y la búsqueda de vida no terrestre: un modelo de segunda generación para moléculas genéticas" (PDF) . Química bioorgánica . 30 (1): 62–80. doi : 10.1006 / bioo.2001.1232 . PMID 11955003 . Consultado el 6 de julio de 2016 .  
  43. ^ "Prof. Gaston Gonnet: cuando la tecnología tiene la clave de la evolución" . ETH Zurich . Consultado el 9 de julio de 2016 .
  44. ^ Gonnet, GH; Cohen, MA; Benner, SA (5 de junio de 1992). "Emparejamiento exhaustivo de toda la base de datos de secuencias de proteínas" (PDF) . Ciencia . 256 (5062): 1443–5. Código Bibliográfico : 1992Sci ... 256.1443G . doi : 10.1126 / science.1604319 . PMID 1604319 . Consultado el 9 de julio de 2016 .  
  45. ^ a b c "La genómica se encuentra con la geología" . Revista AstroBiology . 10 de septiembre de 2001 . Consultado el 1 de julio de 2016 .
  46. ^ Jones, David T. (1999). "Predicción de estructura secundaria de proteínas basada en matrices de puntuación específicas de posición" (PDF) . Revista de Biología Molecular . 292 (2): 195–202. doi : 10.1006 / jmbi.1999.3091 . PMID 10493868 . Archivado desde el original (PDF) el 18 de agosto de 2016 . Consultado el 6 de julio de 2016 .  
  47. ^ Benner, SA; Gerloff, D (1991). "Patrones de divergencia en proteínas homólogas como indicadores de estructura secundaria y terciaria: una predicción de la estructura del dominio catalítico de proteína quinasas". Avances en la regulación de enzimas . 31 : 121–81. doi : 10.1016 / 0065-2571 (91) 90012-b . PMID 1877385 . 
  48. ^ Gonnet, Gaston H .; Korostensky, Chantal; Benner, Steve (febrero de 2000). "Medidas de evaluación de alineaciones de secuencia múltiple". Revista de Biología Computacional . 7 (1–2): 261–276. CiteSeerX 10.1.1.48.4250 . doi : 10.1089 / 10665270050081513 . PMID 10890401 .  
  49. ^ Russell, RB; Sternberg, MJE (mayo de 1995). "Predicción de estructuras: ¿Qué tan buenos somos?" . Biología actual . 5 (5): 488–490. doi : 10.1016 / S0960-9822 (95) 00099-6 . PMID 7583096 . 
  50. ^ Spoto, Giuseppe; Corradini, Roberto, eds. (2012). Detección de ADN genómico no amplificado . Dordrecht: Springer. pag. 104. ISBN 978-94-007-1226-3. Consultado el 6 de julio de 2016 .
  51. ^ Dambrot, Stuart Mason (24 de enero de 2014). "Los lazos que unen: recreando la evolución del ligando darwiniano in vitro" . Phys.org . Consultado el 6 de julio de 2016 .
  52. ^ Jannetto, Paul J .; Laleli-Sahin, Elvan; Wong, Steven H. (1 de enero de 2004). "Metodologías de genotipado farmacogenómico". Química Clínica y Medicina de Laboratorio . 42 (11): 1256–64. doi : 10.1515 / CCLM.2004.246 . PMID 15576288 . S2CID 34338787 .  
  53. ^ "Premio Resumen # 0304569 matrices de nanoescala para perfiles directos de ARN en celdas individuales y sus compartimentos" . Fundación Nacional de Ciencias . Consultado el 6 de julio de 2016 .
  54. ^ Plaxco, Kevin W .; Gross, Michael (2006). Astrobiología: una breve introducción . Baltimore: Prensa de la Universidad Johns Hopkins. págs. 165-170. ISBN 978-0801883675. Consultado el 6 de julio de 2016 .
  55. ^ Benner, Steven A. (junio de 2003). "Proteómica interpretativa: encontrar un significado biológico en las bases de datos del genoma y del proteoma" (PDF) . Avances en la regulación de enzimas . 43 (1): 271–359. CiteSeerX 10.1.1.104.7549 . doi : 10.1016 / S0065-2571 (02) 00024-9 . PMID 12791396 . Consultado el 6 de julio de 2016 .   
  56. ^ Jermann, TM; Opitz, JG; Stackhouse, J; Benner, SA (2 de marzo de 1995). "Reconstrucción de la historia evolutiva de la superfamilia de artiodáctil ribonucleasa" (PDF) . Naturaleza . 374 (6517): 57–9. Código Bib : 1995Natur.374 ... 57J . doi : 10.1038 / 374057a0 . PMID 7532788 . S2CID 4315312 . Consultado el 6 de julio de 2016 .   
  57. ^ Benner, SA; Caraco, MD; Thomson, JM; Gaucher, EA (3 de mayo de 2002). "Biología planetaria - historias paleontológicas, geológicas y moleculares de la vida". Ciencia . 296 (5569): 864–8. Código bibliográfico : 2002Sci ... 296..864B . doi : 10.1126 / science.1069863 . PMID 11988562 . S2CID 2316101 .  
  58. ↑ a b c Liberles, David A. (2007). Reconstrucción de secuencia ancestral . Oxford: Prensa de la Universidad de Oxford. pag. 221. ISBN 9780199299188.
  59. ^ Ward, Peter; Kirschvink, Joe (2014). Una nueva historia de la vida: los nuevos descubrimientos radicales sobre los orígenes y la evolución de la vida en la Tierra . Estados Unidos: Bloomsbury. págs. 55–60. ISBN 978-1608199075. Consultado el 6 de julio de 2016 .
  60. ^ Zimmer, Carl (26 de junio de 2004). "¿Qué fue antes del ADN?" . Descubrir . ISSN 0274-7529 . 
  61. ^ Zimmer, Carl (12 de septiembre de 2013). "Una posibilidad remota para el origen de la vida" . The New York Times . Consultado el 1 de julio de 2016 .
  62. ^ Boyd, Robert S. (11 de noviembre de 2002). "¿ALGUIEN ESTAR HACIA FUERA? Los entornos extremos de la Tierra prueban las ideas de la astrobiología" . Philadelphia Inquirer . Consultado el 6 de julio de 2016 .
  63. ^ Greenwood, Veronique (9 de noviembre de 2009). "Lo que la vida deja atrás Lo que sabemos: la búsqueda de vida más allá de nuestro punto azul pálido está plagada de esperanzas frustradas. ¿Se aplicarán las huellas químicas y minerales de los organismos terrestres en otros mundos?" . Revista de semillas . Archivado desde el original el 15 de noviembre de 2009 . Consultado el 6 de julio de 2016 .CS1 maint: URL no apta ( enlace )
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