El dominio sushi es un dominio proteico conservado evolutivamente . También se conoce como módulos de proteína de control del complemento (CCP) o repeticiones breves de consenso (SCR). El nombre deriva de la similitud visual del dominio con el sushi nigiri cuando se dibuja la estructura primaria que muestra los bucles creados por los enlaces disulfuro . [1]
Dominio de sushi (SCR / CCP) | ||||||||||
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Identificadores | ||||||||||
Símbolo | Sushi | |||||||||
Pfam | PF00084 | |||||||||
InterPro | IPR000436 | |||||||||
CATH | 1g4g | |||||||||
SCOP2 | 1hfi / SCOPe / SUPFAM | |||||||||
CDD | cd00033 | |||||||||
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Los dominios sushi existen en una amplia variedad de proteínas de adhesión y complemento. La estructura es conocida para este dominio; se basa en una disposición de tipo sándwich beta : una cara formada por tres hebras β unidas por hidrógeno para formar una región de triple hebra en su centro, y la otra cara formada por dos hebras β separadas. [2]
CD21 (también llamado receptor C3d, CR2, receptor del virus de Epstein Barr o EBV-R) es el receptor para EBV y para C3d, C3dg e iC3b. Los componentes del complemento pueden activar las células B a través de CD21. CD21 es parte de un gran complejo de transducción de señales que también involucra a CD19, CD81 y Leu13.
Algunas de las proteínas de este grupo son responsables de la base molecular de los antígenos del grupo sanguíneo, marcadores de superficie en el exterior de la membrana de los glóbulos rojos. La mayoría de estos marcadores son proteínas, pero algunos son carbohidratos unidos a lípidos o proteínas. [3] El factor acelerador de la descomposición del complemento (antígeno CD55) pertenece al sistema de grupos sanguíneos Cromer y está asociado con Cr (a), Dr (a), Es (a), Tc (a / b / c), Wd (a ), Antígenos WES (a / b), IFC y UMC. El receptor del complemento tipo 1 (receptor C3b / C4b) (antígeno CD35) pertenece al sistema de grupos sanguíneos Knops y está asociado con los antígenos Kn (a / b), McC (a), Sl (a) e Yk (a).
Subfamilias
- Selectins InterPro : IPR002396
- CD62E
- CD62L
- CD62P
Ejemplos de
Los genes humanos que codifican proteínas que contienen este dominio incluyen:
- AGC1 , APOH ,
- BCAN , BF ,
- C1R , C1S , C2 , C4BPA , C4BPB , C6 , C7 , CD46 , CD55 , CFB , CFH , CFHR1 , CFHR2 , CFHR3 , CFHR4 , CFHR5 , CR1 , CR1L , CR2 , CSMD1 , CSMD2 , CSMD3 , CSPG3 ,
- DAF ,
- F13B , FHR4 , GABBR1 ,
- HP ,
- IL2RA ,
- KIAA0247 ,
- MASP1 , MASP2 ,
- PAPPA , PAPPA2 , psk-3 ,
- RAMPA ,
- SEL-OB , SELE , VENDER , SELP , SEZ6 , SEZ6L , SEZ6L2 , SNED1 , SRPX , SRPX2 , SUSD1 , SUSD2 , SUSD4 , SVEP1 , SEZ6L2 ,
- TAOK1 , TPO , VCAN
Referencias
- ^ Ichinose, Akitada; Bottenus, Ralph E .; Davie, Earl W. "Estructura de las transglutaminasas" . La revista de química biológica . 265 : 13411-13414. PMID 1974250 .
- ^ Campbell ID, Baron M, Day AJ, Sim RB, Norman DG, Barlow PN (1991). "Estructura tridimensional de un módulo de proteína de control del complemento en solución". J. Mol. Biol . 219 (4): 717–725. doi : 10.1016 / 0022-2836 (91) 90666-T . PMID 1829116 .
- ^ Lomas-Francis, Christine; Reid, Marion E. (2004). El antígeno del grupo sanguíneo: libro de hechos . Boston: Prensa académica. ISBN 0-12-586585-6.