TACK es un grupo de arqueas acrónimo de Thaumarchaeota , Aigarchaeota , Crenarchaeota y Korarchaeota , los primeros grupos descubiertos. Se encuentran en diferentes ambientes que van desde termófilos acidófilos hasta mesófilos y psicrófilos y con diferentes tipos de metabolismo , predominantemente anaeróbico y quimiosintético. [2] TACK es un clado cercano a la rama que dio origen a los eucariotas . Se ha propuesto que el clado TACK se clasifique como Crenarchaeotay que la tradicional "Crenarchaeota" sea clasificada como una clase llamada "Sulfolobia", junto con los otros phyla con rango u orden de clase. [3]
VIRAR | |
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Sulpholobus | |
clasificación cientifica | |
Dominio: | |
Reino: | |
Superphylum: | VIRAR Guy y Ettema 2011 |
Phyla [1] | |
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Sinónimos | |
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Clasificación
- Crenarchaeota . Es el borde más conocido y las arqueas más abundantes del ecosistema marino. Anteriormente se les llamaba sulfobacterias debido a su dependencia del azufre y son importantes como fijadores de carbono. Hay hipertermófilos en los respiraderos hidrotermales y otros grupos son los más abundantes a profundidades inferiores a los 100 m.
- Aigarchaeota . Es un filo propuesto a partir del genoma de la especie candidata Caldiarchaeum subterraneum que se encuentra en las profundidades de una mina de oro en Japón . También se han encontrado secuencias genómicas de este grupo en ambientes geotérmicos, tanto terrestres como marinos.
- Geoarchaeota . Incluye organismos termofílicos que viven en ambientes ácidos reduciendo el hierro férrico. Alternativamente, se ha propuesto que este grupo y los anteriores pertenecen realmente al filo Thaumarchaeota.
- Thaumarchaeota . Incluye organismos mesófilos o psicrófilos (temperaturas medias y bajas), de metabolismo quimioautotrófico oxidante amoniacal (nitrificante) y que pueden jugar un papel importante en los ciclos bioquímicos, como los ciclos del nitrógeno y del carbono.
- Bathyarchaeota . Es abundante en los sedimentos del fondo marino con escasez de nutrientes. Al menos algunos linajes se desarrollan a través de la homoacetogénesis, un tipo de metabolismo que hasta ahora se creía exclusivo de las bacterias.
- Korarchaeota . Solo se han encontrado en ambientes hidrotermales y en escasa abundancia. Parecen diversificados en diferentes niveles filogenéticos según la temperatura, la salinidad (agua dulce o marina) y la geografía.
Filogenia
Las relaciones son aproximadamente las siguientes:
McKay y col. 2019 [4] | AnnoTree y GTDB lanzan 05-RS95 [5] [6] | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Referencias
- ^ Castelle CJ, Banfield JF. (2018). "Grandes nuevos grupos microbianos amplían la diversidad y alteran nuestra comprensión del árbol de la vida" . Celular . 172 (6): 1181-1197. doi : 10.1016 / j.cell.2018.02.016 . PMID 29522741 .Mantenimiento de CS1: utiliza el parámetro de autores ( enlace )
- ↑ Guy & Ettema 2011, El superfilo 'TACK' de arqueas y el origen de los eucariotas. Trends Microbiol. Diciembre de 2011; 19 (12): 580-7. doi: 10.1016 / j.tim.2011.09.002. Epub 2011 20 de octubre.
- ^ Cavalier-Smith, Thomas; Chao, Ema E-Yung (2020). "Árboles de proteínas ribosomales multidominio y el origen planctobacteriano de neomura (eucariotas, arqueobacterias)" . Protoplasma . 257 (3): 621–753. doi : 10.1007 / s00709-019-01442-7 . PMC 7203096 . PMID 31900730 .
- ^ McKay, LJ, Dlakić, M., Fields, MW et al. Capacidad genómica concurrente del metano anaeróbico y metabolismos disimilatorios del azufre descubiertos en Korarchaeota . Nat Microbiol 4, 614–622 (2019) doi: 10.1038 / s41564-019-0362-4
- ^ Mendler, K; Chen, H; Parks, DH; Hug, LA; Doxey, AC (2019). "AnnoTree: visualización y exploración de un árbol de la vida microbiano anotado funcionalmente" . Investigación de ácidos nucleicos . 47 (9): 4442–4448. doi : 10.1093 / nar / gkz246 . PMC 6511854 . PMID 31081040 .
- ^ "GTDB release 05-RS95" . Base de datos de taxonomía del genoma .