Charla: predicción de la estructura de las proteínas


En el tercer párrafo, ¿debería vincularse la predicción de la estructura comparativa con el modelado comparativo de proteínas ? 98.192.58.208 21:23, 17 de octubre de 2007 (UTC)

En primer lugar, la afirmación sobre las chaperoninas no es correcta. El descubrimiento de las chaperoninas (y las pequeñas proteínas de las chaperonas) no afectó la afirmación de que la secuencia de aminoácidos codifica completamente el pliegue de una proteína (es decir, la conclusión a la que llegó Anfinsen). Se ha demostrado que todas las chaperoninas ayudan (es decir, aumentan el rendimiento) al proceso de plegado, principalmente para evitar la agregación de la proteína cuando se expone la superficie hidrófoba durante el plegado. En otras palabras, las chaperoninas permiten que una proteína se pliegue en la conformación codificada por su secuencia de aminoácidos de manera más eficiente. Todavía no hay razón para dudar de que toda la información necesaria para reproducir el pliegue de una proteína está en la secuencia de aminoácidos, particularmente en el contexto de la predicción de la estructura de la proteína, donde la agregación intermolecular claramente no es un problema.Consulte la revisión reciente de Saibil & Ranson (Trends Biochem Sci. 2002 Dec; 27 (12): 627-632) para una discusión más completa de lo que se sabe actualmente sobre las chaperoninas.Usuario: Davjon 08:35, 20 de marzo de 2004

Dicho esto, una complicación adicional es que algunas proteínas solo pueden plegarse en su conformación biológicamente útil bajo condiciones particulares (por ejemplo, pH alto o baja temperatura) o en presencia de otras moléculas (por ejemplo, metales) o incluso otras cadenas de proteínas (en la formación de ciertos complejos de proteínas). Usuario: Davjon 08:35, 20 de marzo de 2004

Por último, el término correcto es predicción ab initio de la estructura de la proteína en lugar de modelado de novo . Aunque ambos términos latinos tienen un significado similar, de novo se ha utilizado históricamente en la frase " diseño de proteína de novo " y no en el contexto de la predicción de la estructura de la proteína. Usuario: Davjon 08:35, 20 de marzo de 2004

En la era de la preproteómica del pregenoma, bastantes estructuras estaban determinadas por neutrones. Los electrones son esenciales para hacer cristalografía 2D de proteínas de membrana, que es todo lo que puede hacer con la mayoría de ellas. La oración tal como la tiene ahora es razonable con cristalografía "típicamente" y de rayos X , pero considero que la cristalografía es un artículo mucho mejor. Realmente creo que los dos deberían fusionarse. 168 ... 00:14, 2 de febrero de 2004 (UTC)

Estoy de acuerdo en que deberían fusionarse (pero, tal como están actualmente, la crstallografía de rayos X es más relevante para este artículo). Sin embargo, no creo que ninguno de los artículos sea particularmente brillante. Stewart Adcock 01:50, 3 de febrero de 2004 (UTC)