El Torneo Apertura 2006 fue el torneo de fútbol que abrió la temporada en la primera división paraguaya en el año 2006.
El torneo comenzó el 27 de enero y finalizó el 3 de junio con la participación de 11 equipos, con un sistema de ida y vuelta all play all . El ganador fue Libertad , que obtuvo el derecho a jugar la Copa Libertadores 2007 y la final del campeonato nacional ante Cerro Porteño (ganadores del Clausura 2006 ).